Jälgitakse, kas ristamisel saadud heterosügoodid on mutantse fenotüübiga või komplementeeritud, metsiktüüpi fenotüübiga. Rekombinatsioonitestis uuritakse kas mutatsioonid on aheldunud ja kui on, siis kui kaugel nad asuvad üksteisest kromosoomis. Mida lähemal asuvad, seda madalam on rekombinatsioonisagedus. Komplementatsioonitesti piirangud: · Uuritavad mutatsioonid ei tohi olla dominantsed või kodominantsed · Kui toimub geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon. Komplementatsioonitesti kasutamine on raskendatud polaarsete mutatsioonide puhul. Seda saab rakendada ainult retsessiivsete mutatsioonide testimisel. 80. Komplekssed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing, immuunvastuse kujunemise geneetiline taust. Alternatiivne splaissing ühel geenil on mitu võimalikku produkti. Seega geenid ei ole alati ühetähenduslikud
nad asuvad üksteisest kromosoomis. Komplementatsioonitest näitab kas ristamisel saadud heterosügoodid on mutantse fenotüübiga või metsiktüüpi fenotüübiga.Rekombinatsioonitest võib toimida nii komplementeerivate kui ka mittekomplementeerivate tunnuste korral kuid seda erineva sagedusega. Rekombinatsioonitesti puhul ei teki rekombinante. Komplementatsioonitesti piiranguteks on:*uuritavad mutatsioonid ei tohi olla dominantsed või kodominantsed;*ei ole rakendatav siis kui toimub geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon. Komplementatsioonitesti kasutamist on trakendatud polaarsete mutatsioonide puhul. 80)Kompleksed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing, immuunvastuse kujunemise geneetiline taust. Alternatiivne splaissing on see kui erinevate eksonite kombinatsioonid kodeerivad erinevate omadustega valke. Alternatiivset splaissingut on kirjeldatud imetajate -globiini puhul ja kanade ovalbumiini puhul
on alleelsed). Jälgitakse, kas ristamisel saadud heterosügoodid on mutantse fenotüübiga või komplementeeritud, metsiktüüpi fenotüübiga. Rekombinatsioonitesti abil uuritakse, kas mutatsioonid on aheldunud (asuvad samas kromosoomis) ja kui on, siis kui kaugel nad teineteisest krom-s asuvad. Kompl.testi piirangud: saab rakendada ainult rets mutatsioonide testimisel. + Ei ole rakendatav siis, kui toimub geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon(?). + Tulemuste analüüs on raskendatud epistaatiliste mutatsioonide puhul, kus üks mut mõjutab teise avaldumist. + Polaarsete mut-de puhul mõjutab mutatsioon mitte üksnes selle geeni avaldumist, kus ta asub, vaid ka külgnevate geenide avaldumist. 79. Komplekssed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing, immuunvastuse kujunemise geneetiline taust.
79. Komplementatsioonitesti rakendus, selle erinevus rekombinatsioonitestist. Komplementatsioonitesti piirangud. Komplementatsioonitest näitab, kas mutatsioonid on alleelsed ehk kas nad paiknevad ühes ja samas geenis. Jälgitakse, kas ristamisel saadud heterosügoodid on mutantse fenotüübiga või komplementeeritud, metsiktüüpi fenotüübiga (Piirangud: uuritavad mutatsioonid ei tohi olla dominantsed või kodominantsed; ei ole rakendatav siis kui toimub geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon testi saab rakendada ainult retessiivsete mutatsioonide testimisel). Rekombinantsioonitestis aga uuritakse kas mutatsioonid on aheldunud ja kui on, siis kui kaugel nad asuvad üksteisest kromosoomis. 80. Komplekssed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing, immuunvastuse kujunemise geneetiline taust. Geenide ja polüpeptiidide kolineaarsus ei pruugi selle algses tähenduses alati kehtida: geenide kattuvus (sama
on alleelsed (ei komplementeeri), kuid struktuurselt mittealleelsed (annavad rekombinante), nimetatakse heteroalleelseteks mutatsioonideks. Mutantsed heteroalleelid sisaldavad mutatsioone sama geeni erinevates kohtades. 11.9. Intrageenne komplementatsioon Geenisisene komplementatsioon esineb mõningatel juhtudel, kui meil on tegemist vakkudega, ku nende funktsionaalsed vormid on dimeersed või velgi rohkem, multimeersed, koosnedes mitmetest polüpeptiididest. Geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon esineb mõnikord siis, kui on tegemist multimeersete valkudega, mis koosnevad kahest või enamast polüpeptiidist. Kui tegemist on valguga, mis koosneb sama geeni poolt kodeeritud polüpeptiididest (homodimeer, homotetrameer jne.), võivad kaks erinevat mutatsiooni sisaldavat polüpeptiidi ühe valgu koostises olles teineteise defekte osaliselt või täielikult komplementeerida 11.10. Komplementatsioonitesti kasutamise limitatsioonid
või komplementeeritud, metsiku fenotüübiga. · Rekombinatsioonitestis aga uuritakse, kas mutatsioonid on aheldunud (asuvad samas kromosoomis) ja kui on, siis kui kaugel nad asuvad üksteisest kromosoomis. Mida lähemal asuvad, seda madalam on rekombinatsioonisagedus. · Piirangud komplementatsioonitestil: Uuritavad mutatsioonid ei tohi olla dominantsed või kodominantsed Ei ole rakendatav geenisiseste mutatsioonide komplementatsioonil. On raskendatud polaarsete mutatsioonide puhul. 80. Komplekssed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing, immuunvastuse kujunemise geneetiline taust. · Alternatiivne splaissing erinevate eksonite kombinatsioonid kodeerivad erinevate omadustega valke. · Alternatiivne splaissing võib olla ka koespetsiifiline. · Iga antikeha (immunoglobuliin, Ig), mis seondub spetsiifiliselt ainult tema poolt
Jälgitakse, kas ristamisel saadud heterosügoodid on mutantse fenotüübiga või komplementeeritud, metsiktüüpi fenotüübiga. Rekombiatsioonitestis aga uuritakse kas mutatsioonid on aheldunud ja kui on siis kui kaugel nad asuvad üksteisest kromosoomis. Komplementatsioonitesti piiranguteks on: *uuritavad mutatsioonid ei tohi olla dominantsed või kodominantsed; *ei ole rakendatav siis kui toimub geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon. Komplementatsioonitesti kasutamist on trakendatud polaarsete mutatsioonide puhul. Komplementatsioonitesti saab rakendada ainult retsessiivsete mutatsioonide testimisel. 80. Komplekssed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing, immuunvastuse kujunemise geneetiline taust. Alternatiivne splaissing - erinevate eksonite kombinatsioonid kodeerivad erinevate omadustega valke. Alternatiivne splaissing võib vahel olla koespetsiifiline. Nt
(lämmastikaluste ja nukleotiidide väljalõikamine); DNA "mismatch" reparatsioon; SOS vastus ja rekombinatsiooniline reparatsioon. DNA rekombinatsioonimehhanismid. Geeni konversioon. 15. Geeni definitsioon. Geeni kontseptsiooni areng. Geeni struktuuri kirjeldamine: geeni peenstruktuuri uurimine; geenide ja polüpeptiidide kolineaarsus. Geeni geneetiline definitsioon: cis- ja trans- konfiguratsioonid; komplementatsioonitest, selle erinevus rekombnatsioonitestist; geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon; komplementatsioonitesti piirangud. Komplekssed seosed geenide ja polüpeptiidide vahel: alternatiivne splaissing; geenisegmentide assambleerimine erinevaid immunoglobuliine kodeerivateks DNA järjestusteks. 1. Sissejuhatus: klassikaline ja molekulaargeneetika, geneetika rakendus kaasajal Klassikalise ja molekulaargeneetika kujunemine Geneetika on suhteliselt noor teadus
funktsiooni alusel alleelsed (komplementatsioonitesti põhjal, ei komplementeeri teineteist vastastikku), nimetatakse homoalleelseteks mutatsioonideks. Seevastu mutatsioone, mis komplementatsioonitesti põhjal on alleelsed (ei komplementeeri), kuid struktuurselt mittealleelsed (annavad rekombinante), nimetatakse heteroalleelseteks mutatsioonideks. Mutantsed heteroalleelid sisaldavad mutatsioone sama geeni erinevates kohtades. Geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon Geenisiseste mutatsioonide komplementatsioon esineb mõnikord siis, kui on tegemist multimeersete valkudega, mis koosnevad kahest või enamast polüpeptiidist. Kui tegemist on valguga, mis koosneb sama geeni poolt kodeeritud polüpeptiididest (homodimeer, homotetrameer jne.), võivad kaks erinevat mutatsiooni sisaldavat polüpeptiidi ühe valgu koostises olles teineteise defekte osaliselt või täielikult komplementeerida. 92