Inimese genoomi CpG "saarekestel" paiknevate geenide kloneerimine (genoomse DNA restriktsioon Cfr42I (SacII) abil, fragmentide kloneerimine pBS SK+ plasmiidi, E.coli transformatsioon, rekombinantse klooni eraldamine, restriktsioon-analüüs, PCR, sekveneerimine, bioinformaatiline analüüs) Imetajate genoomides on mitmed geenid koondunud nn. CpG saarekestele (CpG islands). CpG saareke on vähemalt 200 bp pikkune DNA lõik, milles on dinukleotiidi GC sisaldus vähemalt 50 %. Tavaliselt leidub CpG saarekesi (eriti koduhoidja-)geenide transkriptisooni alguspunktides või nende lähedal. Mujal genoomi piirkondades on CpG dinukleotiidi vähe, sest sellise dinukleotiidi tsütosiin metüleeritakse (replikatsioonijärgselt aitab eristada värskelt sünteesitud DNA ahelat vanast ahelast). Ekspresseeruvate geenide promootorpiirkondi ei metüleerita. Metüleeritud tsütosiin allub kergesti
Inimese genoomi CpG "saarekestel" paiknevate geenide kloneerimine (genoomse DNA restriktsioon Cfr42I (SacII) abil, fragmentide kloneerimine pBS SK+ plasmiidi, E.coli transformatsioon, rekombinantse klooni eraldamine, restriktsioon-analüüs, PCR, sekveneerimine, bioinformaatiline analüüs) Imetajate genoomides on mitmed geenid koondunud nn. CpG saarekestele (CpG islands). CpG saareke on vähemalt 200 bp pikkune DNA lõik, milles on dinukleotiidi GC sisaldus vähemalt 50 %. Tavaliselt leidub CpG saarekesi (eriti koduhoidja-)geenide transkriptisooni alguspunktides või nende lähedal. Mujal genoomi piirkondades on CpG dinukleotiidi vähe, sest sellise dinukleotiidi tsütosiin metüleeritakse (replikatsioonijärgselt aitab eristada värskelt sünteesitud DNA ahelat vanast ahelast). Ekspresseeruvate geenide promootorpiirkondi ei metüleerita. Metüleeritud tsütosiin allub kergesti
rRNA ribosoomide struktuuri ja funktsiooni alus, toimib toena ribosoomsetele valkudele snRNA on oluline eukarüootsete geenide esmaste transkriptide protsessingul küpseks mRNA'ks enne eksporti tuumast tsütoplasmasse. siRNA osaleb transkriptsioonijärgses geenide vaigistamises d) lokalisatsioon rakus RNA'd sünteesitakse tuumas, seejärel transporditakse aga tsütoplasmasse 13. Joonistage mingi riboosi sisaldava dinukleotiidi põhimõtteline struktuur. Identifitseerige, milline on 5'- ja milline 3'- ots ning iseloomustage nukleotiide ühendavat kovalentset sidet. Nukleotiide ühendav kovalentne side moodustub aatomite omavahelisel elektronide jagamise teel. riboos 14. Nukleaasid on ensüümid, mis hüdrolüüsivad
Muud faktorid, mis mõjutavad kataboliitsele repressioonile alluvate geenide transkriptsiooni Lisaks cAMP-CRP-sõltuvale transkriptsiooni aktivatsioonile ja alternatiivsete sigma faktorite poolt vahendatud transkriptsiooni aktivatsioonile mõjutab kataboliitsele repressioonile alluvate geenide aktivatsiooni rakusisene ppGpp kontsentratsioon. ppGpp hulk suureneb nälgivates rakkudes. Samuti mõjutab nende geenide transkriptsiooni indool-3-äädikhappe, -ketovõihappe ning dinukleotiidi AppppA rakusisese kontsentratsiooni muutus. 47 11. N-allikate kasutamise regulatsioon Enterobakterid kasutavad N-allikana erinevaid lämmastikku sisaldavaid ühendeid, kuid eelistatuim neist on ammoonium. Seda on lihtne jälgida näiteks rakkude kasvukiiruste võrdlemisel minimaalsöötmetel, mis sisaldavad erinevaid N-allikaid. N2 fikseerimine atmosfäärist