haplotüübiplokid. Kui võrreldi eestlasi ja lääneeurooplasi, siis erinevused ei olnud nii suured, kuigi varieeruvust on näha. Samas kui võrrelda näiteks hiina ja jaapani populatsiooniga, siis on erinevusi näha küll. 58. Funktsionaalne genoomika, ülegenoomne mRNA analüüs cDNA kiipidel.. Funktsionaalne genoomika on geeni funktsioonide üle genoomi analüüs. GeneChip kasutatakse transkriptide uurimisel. Kõigepealt tehakse märgistamata cDNA alusel cRNA, lisades juurde biotiinimolekul, mis hiljem tuntakse ära fluorofooriga seotud avidiiniga afiinsusseostumise abil. Biotiiniga cRNA molekulid kantakse kiibile ja lastakse hübridiseeruda. Iga individuaalne täpp kiibil sisaldab mitu koopiat ühesugust DNA järjestust. Iga individuaalse täpp peegeldab vastava mRNA hulka algses populatsioonis. 59. Geeniteraapia põhimõtted ja põhimeetodid. (sugurakud/somaatilised rakud; in vivo/ex vivo), GT
Osa M- valgust asub ka RNP superspiraali siseküljel. VSV infektsioonitsükkel VSV replitseerub nakatatud rakkude tsütoplasmas. Infektsioonitsükkel kestab ca 12h ja lõpeb raku surmaga. Replikatsioon ja transkriptsioon on teineteisest täiesti erinevad protsessid: Transkriptsioon on genoomsel (negatiivsel) RNP maatritsil mRNA-de (vaba RNA molekul) süntees. Replikatsioon on genoomsel RNP-l (vRNA) täieliku antigenoomse RNP (cRNA) süntees ja sellel omakorda genoomse RNP (vRNA) süntees. Antigenoomne cRNA ehkki on positiivse polaarsusega , ei ole kunagi translatsiooniliseks matriitsiks ja on alati pakitud nukleokapsiidi. VSV genoomi transkriptsioon Transkriptsioon algab enamasti genoomi 3’- otsas. Esimesena kopeeritakse 47 b pikkune liiderjärjestus, mille sünteesi järel transkriptsioon katkeb ja liider RNA vabaneb ja liigub rakutuuma. Peale liider- RNA järjestuse
Metagenoomika a. Struktuurne genoomika b. Personnaalne genoomika 10. Mikrokiiptehnoloogia DNA-mikrokiiptehnoloogia (ingl. DNA microarray technology)- Molekulaarbioloogias kasutatav multiplekstehnoloogia, kus tahkele kandjale (klaas, silikon Affymetrix-kiipidel või kuulikestele Illumina platformil) kovalentselt kinnitatud kümneid tuhandeid spetsiifilisi oligonukleotiidseid järjestusi hübriiditakse spetsiifiliste cDNA- või cRNA-proovidega. 11. Immuunsüsteemid immuunsüsteem (ingl. Immune system)- Organismide bioloogiliste struktuuride ja protsesside süsteem, mis kaitseb organismi haiguste eest, tappes patogeene ja kasvajarakke. Kemikaalid, viirused, kiirgused, bakterid. 12. Kaasasündinud immuunsus Kaasasündinud immuunsus a. Keemiline kaitse - Põletik - Komplemendisüsteem b. Rakuline kaitse - Patogeeni spetsiifilisus 13. Adaptiivne immuunsus a
2004; Fantozzi et al. 2008; Morisset et increase of the distance that separates the al. 2008). Recently, a novel DNA-based reporter fluorophore from the quencher technology has been developed, the NASBA moiety. The most relevant hybridization Implemented Microarray Analysis (NAIMA) probes are those containing hairpins such as (Morisset et al. 2008). In this technology, a Molecular Beacons, Scorpion primers, and cRNA product is obtained from a consecu- 508 Chapter 29 tive first primer extension reaction, using junction regions of DNA from different tailed primers, and a subsequent transcrip- origins, and flanking regions of the intro- tion-based amplification, using universal duced construction, which aims to determine primers. The NAIMA product is directly which GMO is present in the sample, and