(“cap”). Ω-liider osaleb ka TMV genoomi replikatsioonis. Subgenoomsed promooterid asuvad sgRNA-de transpkriptsioonisaitidest ülapool. o MP sgRNa sünteesitakse infektsioonifaasis ja suhteliselt vähesel hulgal. o CP sgRNA sünteesitakse hiljem ja ta on väga mažoorne. IRES- elemendid (võivad erinevatel tobamoviirustel asuda MP ja /või CP geeni ees) ning võimaldavad vastavate valkude transaltsiooni otse genoomselt RNA-lt. Genoomi 3’ ots moodustab tRNA like struktuuri. Viiruse seisukohalt on tRNA-like struktuur negatiivse RNA ahela sünteesil promootoriks ja arvatavasti ka kaitseks raku ribonukleaaside vastu. TMV genoomi kodeerivad alad ORF1- 126 kDa valk, TMV replikaasi subühik, seondub infitseeritud rakkudes membraaniga. Osaleb viiruse genoomse ja sgRNA-de cap-imisel ja sisaldab RNA- helikaasset domeeni.
valgusünteesil nn matriisi osa. tRNA – molekulid transpordivad aminohappeid kui valkude “ehitusplokke“ valgusünteesi toimumispaika. rRNA – moodustab enamuse kogu RNA-st, on ribosoomide struktuurseks komponendiks. 8. Valgusünteesi biokeemiline mehhanism: 9. Transkriptsioon: Transkriptsioon on RNA molekulide süntees DNA põhjal. Ensüümiks RNA polümeraas. Valmis sünteesitud mRNA lahkub tuumast ja liigub tsütoplasmasse, kus ribosoomides toimub valgu süntees. 10. Translatsioon: Transaltsiooni all mõistame sisuliselt valgu sünteesi, mis on justkui geneetilise info “tõlkimine“ nukleiinhapete keelest valkude keelde. Igale kolmele järjestikusele nukleotiidile ehk triplentile mRNA-s vastab üks aminohape sünteesitavas polüpeptiidahelas. 11. Geneetilise koodi olemus ja lühiiseloomustus: 18 Maris Kallus KKS 2010
Universaalsus (ühesugune koodonite ja aminohapete vastavus eksisteerib peaaegu kõigi eel- ja päristuumste organismide rakkudes). Sünonüümsus (Ühele aminohappele vastab mitu koodonit). Ühetähenduslikkus (Üks koodon määrab alati ühe aminohappe). Mittekattuv (ükski mRNA nukleotiid ei kuulu samaaegselt kahte kõrvuti asetsevasse koodonisse). Pidev. 36 Transaltsiooni protsess Iga mRNA molekul on varustatud nii translatsiooni algus- kui ka lõppkoodoniga. Algus- ehk initsiaatorkoodoniks on alati mRNA nukleotiidne järjestus AUG. Initsiaatorkoodon määrab ära nö lugemisraami.Valgusünteesi lõppu tähistavaid koodoneid on kolm: UGA, UAA, UAG. Neile ei vasta ükski aminohape. Kui translatsioon jõuab üheni nendest, siis valgusüntees lõpeb ja st nimetatakse neid stoppkoodoniteks. Translatsioon algab mRNA ühinemisest ribosoomiga