vesinikperoksiidiks: O2- + O2- H2O2 + O2 · Katalaas: katalüüsib peroksiidi lagunemist veeks ja hapnikuks: 2H2O2 2H2O + O2 · Peroksüdaas: katalüüsib vesinikperoksiidi ja alkoholi vahelist reaktsiooni, mille tulemusel tekivad vesi ja aldehüüd: H2O2 +R-OH H2O + R-CHO · Peroksüredoksiin: katalüüsib peroksiidi ja tioredoksiini vahelist reaktsiooni, tekib vesi ja oksüdeeritud tioredoksiin. METABOLISMI INTEGRATSIOON 1. ATP, NADPH ja lähteühendid biosünteesiks. NADPH on vajalik rasvhapete, kolesterooli ja türosiini biosünteesiks. 2. Metabolismi regulatsiooni üldised mehhanismid ja näited konkreetsetest radadest. Rasvhapete oksüdatsioon mitokondrites aeglustub siis, kui rasvhapete biosüntees tsütosoolis on aktiivne, sest malonüülCoA inhibeerib karnitiini atsüültransferaasi I. (allosteeriline regulatsioon, kompartmentalisatsioon)
1. rohkem või vähem suletud aktiivtsentri topoloogia. Suletus vähendab dissotsiatsiooni tõenäosust osaliselt suletud struktuurid polümeer on osaliselt ümbritsetud valgu poolt, aga mitte täielikult. Võib seostuda ka polümeeri keskele endo. . Endotsellulaasid on väiksema protsessiivsusega mida suletum, seda kõrgem on protsessiivsus. suletud assümeetrilised struktuurid T7 puhul DNA seondumisel tekib suletud olek, tioredoksiin on protsessiivsusfaktor, sest selle puudumisel pole ensüüm protsessiivne. Punktiirjoon natiivselt arvatakse, et on sealt ühendatud, aga kristallstruktuuris ei paista välja. suletud sümmeertilised struktuurid ehk torroidid ümbritseb täielikult substraati, dissotsieerumise tõenäosus väike. Ensüümid on pm lõpmatu protsessiivsusega, liiguvad niikaua, kuni töö on tehtud. 2
Bakterirakus on kirjeldatud 2 polü(A) polümeraasi PAP I ja hiljuti PAP II. PAP I on pcnB geeni produkt. PAP I mõju RNA stabiilsusele kirjeldati esmakordselt RNA I puhul. RNA I on ColE1 plasmiidide replikatsioonil repressorina toimiv antisens-RNA, mis interakteerub plasmiidi replikatsiooni initsiatsioonil praimerina toimiva RNA-ga. PAP I-defektsetes mutantides on kirjeldatud mitmete mRNA-d stabiliseerumist: lpp - lipovalk ompA - välismembraani valk A trxA - tioredoksiin rpsO - ribosoomi valk S15 3' otsas polü(A)-järjestust sisaldavad RNA molekulid on PNPaasi ja RNaas II poolt paremini atakeeritavad, kuna polü(A)-järjestus võib olla nende nukleaaside kinnitumiskohaks muidu vahetult 3' otsas sekundaarstruktuuri sisaldavatele mRNA-dele. Kui rakud on defektsed nii PAP I kui ka PAP II suhtes, on see rakkudele letaalne. Arvatakse, et mRNA polüadenüleerimine on bakterirakus pidevalt toimuv protsess,