atgacaattccttctgaccag 8) Restriction Summary Restriction Summary results doesn't cut cuts once cuts twice cuts three times Results for linear 1053 residue sequence "eco:b2097 fbaB, dhnA; fructose-bisphosphate aldolase class I [EC:4.1.2.13]; K01623 fructose-bisphosphate aldolase, class I (N)" starting "atgacagata" Site: Positions: AatI agg|cct none AatII gacgt|c none Acc16I tgc|gca 15, 372, 567 AccII cg|cg 114, 361, 482, 933 AccIII t|ccgga none AclI aa|cgtt none AcvI cac|gtg none AfaI gt|ac 170, 913 AfeI agc|gct none AflII c|ttaag none AgeI a|ccggt 662 AhlI a|ctagt none Alw441 g|tgcac none
a/h Selle tulemusena on täieliku koodi lugemiseks vaja oluliselt vähem kui 61 tRNAd 5' antikooon 3' koodon G paardub U või C C Paardub G A Paardub U U paardub A või G I (Inosiin) Paardub A, U, või C I = posttranskriptoorne modifitseeritud puriin TTT TCT TAT TGT TTC TCC TAC TGC TTA TCA TAA TGA Geneetilised koodid TTG TCG TAG TGG CTT CCT CAT CGT CTC CCC CAC CGC CTA CCA CAA CGA CTG CCG CAG CGG ATT ACT AAT AGT ATC ACC AAC AGC ATA ACA AAA AGA ATG ACG AAG AGG GTT GCT GAT GGT GTC GCC GAC GGC GTA GCA GAA GGA GTG GCG GAG GGG PHE SER TYR CYS PHE SER TYR CYS LEU SER STOP STOP LEU SER STOP TRP LEU LEU LEU LEU PRO HIS ARG PRO HIS ARG
-35 element ei pruugi sugugi sarnaneda TTGACA järjestusele, ometigi mutatsioonid selles piirkonnas muudavad sigmaS-ga transkriptsiooni regulatsiooni isegi siis, kui järjestus ei sarnane TTGACA-ga. -10 element on suhteliselt sarnane sigmaD -10 elemendiga. -10 elemendist ülesvoolu on konserveerunud lisanukleotiidid, mida sigmaD -10 elemendil pole. SigmaS-i promootorite vaheala pikkus varieerub rohkem kui sigmaD vaheala pikkus. SigmaN (-24 element, vaheala, -12 element) TGGCAC N6 TGC E. coli sigmaN-i konsensus DNA-l erineb sigmaD konsensusest tugevasti ning põhimõtteliselt seisneb -12 positsioonis konserveerunud GC-s ja -24 positsioonis konserveernud GG-st. SigmaH (-35 element, vaheala, -10 element) CCTTGAA N 14(1) CCCATTTA SigmaF (-35 element, vaheala, -10 element) TAAAGTTT N 11 GCCGATAA RNAP on väga suur valk, u 450 kDa raske, ning sellest johtuvalt katab RNAP DNA promootoralas kuni 110 nukleotiidi (-90 ... +20 nukleotiidi geeni esimesest nukleotiidist)