kõige sagedamini esinev stop-koodon bakterites. RF-1 ja RF-2 käituvad ribosoomis nagu tRNA molekulid seondudes ribosoomil samasse piirkonda (A saiti) interakteerudes nii 30S kui 50S subühikutega. Seega on ka siin tegemist molekulaarse mimikri nähtusega. Terminatsioonifaktorid RF-1 ja RF-2 vajavad seondumiseks ribosoomi A saidis eksopneeritud vastavat stop-koodonit ja P saidis polüpeptidüül- tRNA'd. Kui ribosoomis on lühike peptidüül-tRNA, siis ei ole terminatsioonifaktorite seondumine ribosoomidega stabiilne ja järelikult on terminatsiooni toimumine vähese efektiivsusega. RF-3 seondub ribosoomiga siis kui ribosoomis on juba RF-1 või RF-2. RF-3 stimuleerib RF-1 ja RF-2 suunatud reaktsiooni, peptidüül-tRNA hüdrolüüsi, mille tulemusena vabaneb ribosoomist polüpeptiidahel. mRNA vabanemiseks on vajalik RRF. Stop koodonid ei ole ribosoomis võrdsed valgusünteesi lõpetamise suunamisel. Kuigi
seondumist. Selles osaleb elongatsioonifaktor Tu (EF-Tu; väike GTP-ase). Toimub peptiidsideme moodustamine ja translokalisatsioon : ribosoom liigub 3 nukleotiidi võrra edasi, peptidüül tRNA paigutub taas P- saiti. Seda protsessi katalüüsib elongatsioonifaktor G (EF- G). EF- Tu- GDP kompleksi konverteerimist EF- TU-GTP kompleksiks vahendab elongatsioonifaktor Ts (EF- Ts). TERMINATSIOON toimub, kui A- saiti satub terminaator-koodon. Terminaator- koodonid tuntakse ära terminatsioonifaktorite poolt (release factor, RF) poolt: RF1 tunneb ära UAA ja UAG koodonid. RF2 tunneb ära UAA ja UGA koodonid. Need faktorid käivitavad peptidüül- RNA-s asuva estersideme hüdrolüüsi ja vabastavad sellega sünteesitud valgu ribosoomi küljest. Kolmas factor RF3 , katalüüsib RF1 ja RF2 vabanemist peale terminatsiooniprotsessi. NB! 1. Prokarüootses rakus on transkriptsioon ja translatsioon sageli samaaegsed. 2
- promootori puhastamine – kui initsiatsioon läheb üle elongatsiooniks. - RNA polümeraas seondub DNA promootorpiirkonnaga koos lisafaktoritega, mis ahela pikendamisel ei osale. trans faktorid. Need on transkriptsiooni aktiveerivad faktorid – TAF (eukarüootsetes) organismides). - Lisafaktorid osalevad promootori äratundmises ja aitavad RNAP seonduda „õige“ DNA piirkonnaga. - RNA sünteesi lõpetamine toimub prokarüootides terminatsioonifaktorite abil – rho-sõltuv (pööratud kordusjärjestused, 20 järjestust, milles 8 AT paari, GC paarid on tugevamad) terminatsioon või ilma nendeta. - Eukarüootsete transkriptsioon toimub terminatsioonifaktorite vahendusel Kui rho faktor tunneb ära sünteesitud RNA järjestuse, seondub ta RNA-ga. RNA ahel vabastatakse transkriptsioonikompleksist. Kui promootor vabaneb sealt, saab sinna seostuda uus RNA polümeraas ja alustada uut RNA sünteesi. Ühelt geenilt võib