Viiruse seisukohalt on tRNA-like struktuur negatiivse RNA ahela sünteesil promootoriks ja arvatavasti ka kaitseks raku ribonukleaaside vastu. TMV genoomi kodeerivad alad ORF1- 126 kDa valk, TMV replikaasi subühik, seondub infitseeritud rakkudes membraaniga. Osaleb viiruse genoomse ja sgRNA-de cap-imisel ja sisaldab RNA- helikaasset domeeni. ORF2- 183 kDa valk, TMV replikaasi katalüütiline subühik. Translatsioon toimub UAG terminaatorkoodoni mahasurumise teel (“read-through” strateegia). Mahasurumise efektiivsus on ca 5-10%. MP, movement protein, sünteesitakse sgRNA-lt: hüdrofoobne, seondub membraanide ja rakuseintega ning on TMV transpordivalguks: MP seondub kooperatiivselt viiruse RNA-ga ja moodustab transpordikomplekse; MP seondub ka plasmodesmidega (ülipeened tsütoplasmaniidi mis seovad rakke omavahel) ja laiendab neid. MP seondub ka mikrotorukeste ja aktiinfilamentidega
terminaatorkoodonist: UAA, UAG, UGA. Terminaatorkoodonid tuntakse ära lahustuvate valkude, terminatsioonifaktoride ehk RFde poolt. Terminatsioonifaktorid kuuluvad kahte klassi. Bakteriaalsed esimese klassi faktorid tunnevad terminaatorkoodoneid ära erinevalt. Mõlemad tunnevad ära UAA, RF-1 tunneb ära ka UAG ja RF-2 tunneb ära veel UGA. Eukarüootidel on vaid üksainus esimese klassi faktor ehk eRF kõigi kolme terminaatorkoodoni tarbeks. Terminatsioonifaktori esinemisel A-saidis muudetakse peptidüüli transferraarset aktiivsust nii, et ta lisab moodustuva polüpeptiidahela viimase aminohappe karboksüülotsa veemolekuli. Reakstiooni tulemusel vabaneb polüpeptiid tRNA molekulist. Terminatsioon lõpeb mRNA molekuli vabanemisega ribosoomist ja ribosoomi dissotsiatsiooniga alaüksusteks, mida katalüüsib ribosoomi vabanemisfaktor RRF (teise klassi
Formiaadi lagundamist katalüüsib formiaat-vesiniklüaasi kompleks, milles sisalduvad formiaadi dehüdrogenaas H (fdhF geen) ja hüdrogenaas 3 (hycE). Kompleks on membraaniga assotsieerunud ja koosneb paljudest komponentidest. Kompleksi katalüütilise aktiivsuse avaldumiseks on vaja molübdeeni kofaktorit, Ni ja Fe. Formiaadi dehüdrogenaas H 140-ndas positsioonis asub selenotsüsteiin (tsüsteiini S on asendatud seleeniga), mis on kodeeritud terminaatorkoodoni UGA poolt. Selenotsüsteiini lülitamine UGA vastu kasvavas polüpeptiidahelas toimub tRNASec ja terve rea translatsioonifaktorite toimel. Kui ensüümis on selenotsüsteiini asemel tsüsteiin, langeb ensüümi katalüütiline aktiivsus ligi 2 suurusjärku. Formiaadi metabolismil osalevat ensüümkompleksi kodeerivad geenid on rakkude anaeroobsel kasvul aktiveeritud regulaatorvalgu FhlA poolt. Transkriptsiooni aktivatsiooni signaalmolekuliks on formiaat.
annaabi.ee 
