Atsükloviir - nukleosiidne analoog, mis viirusega nakatunud rakus aktiivseks trifosfaadiks fosforüleeritakse. Viiruse tümidiin-kinaas muudab atsükloviiri 100x kiiremini monofosfaadiks kui raku enda ensüüm. Kuna Atsükloviir sarnaneb deoksüguanosiini triP-ga, toimib ta kahtepidi: Esiteks võib ta seostuda viiruse DNA polümeraasiga ning seda inhibeerida. Teiseks võib DNA polümeraas katalüüsida ravimi seondumist DNA ahela külge, mispuhul toimib ta ahela terminaatorina, kuna tal puudub suhkur, mille külge järgmine nukleotiid liita. Valaciclovir (Atsükloviiri L-valüülester) - hüdrolüüsitakse maksas ja sooltes atsükloviiiks ja seeläbi ka piisav konts veres. Toimib erinevalt atsükloviirist-st suukaudselt võttes. Desciclovir lahustub atsüklovirist vees paremini. Ganciclovir toimib erinevalt atsüklovirist nii viiruse α- kui ka β-rühma viirusele. Valganciclovir toimib suu kaudu manustatuna. Famciclovir toimib suu kaudu manustatuna.
Initseerimine N-geenil võib toimuda nii peale liider- RNA sünteesi kui ka otse. N- geeni initseerimine on ainus mis võib toimuda vahetult, kõik ülejäänud initseerimised nõuavad eelneva transkripti sünteesi termineerimist. Sellist transkriptsioonipilti seletavat mudelit nimetatakse reinitsiatsiooni mudeliks (stop and start mudel). (U)7 järjestus geenide ahelas toimib nii poly(A)- signaali ja terminaatorina kui ka transkriptsiooni re-initsieerimisel olulise järjestusena. Replikatsioon Viirus- spetsiifiliste valkude kogunemine initseerib ümberlülitamise transkriptsioonilt replikatsioonile. Selle tõttu sõltub VSV replikatsioon aktiivsest ja kestvast viirus- spetsiifilisest valgusünteesist (eriti N- ja P valkude süntees). Replikatsiooni käigus ignoreerib RdRp liider- RNA-le järgnevaid ja geenide vahelisi “stop-signaale”. Kahe polümeraasi mudel:
Transkriptsiooni terminatsiooni põhjustav sekundaarstruktuur lõhutakse transkriptsiooni ja translatsiooni koosmõjul. 20 nt enne liiderpeptiidis olevat terminatsioonisaiti asuvad 8 uridiinnukleotiidi. UTP madala kontsentratsiooni korral aeglustub traskriptsiooni elongatsioon U-järjestuse sünteesil. Sel juhul jõuab transleeriv ribosoom RNA polümeraasile järele ning nende koostoime tulemusena lõhutakse transkriptsiooni terminaatorina toimiv sekundaarstruktuur. Kõrge UTP kontsentratsiooni korral RNA polümeraas U-järjestuse kohal ei peatu, mistõttu translatsiooni ja transkriptsiooni koosmõjul ilmnevat RNA sekundaarstruktuuri lõhkumist ei toimu. Esitatud mudeli tõepärasust kinnitavad katsed ribosoomi mutantidega, kus translatsiooni elongatsioon toimub aeglasemalt ning sel juhul väheneb proportsionaalselt ka operoni transkriptsioonitase. Translatsioon
Transkriptsiooni terminatsiooni põhjustav sekundaarstruktuur lõhutakse transkriptsiooni ja translatsiooni koosmõjul. 20 nt enne liiderpeptiidis olevat terminatsioonisaiti asuvad 8 uridiinnukleotiidi. UTP madala kontsentratsiooni korral aeglustub traskriptsiooni elongatsioon U-järjestuse sünteesil. Sel juhul jõuab transleeriv ribosoom RNA polümeraasile järele ning nende koostoime tulemusena lõhutakse transkriptsiooni terminaatorina toimiv sekundaarstruktuur. Kõrge UTP kontsentratsiooni korral RNA polümeraas U-järjestuse kohal ei peatu, mistõttu translatsiooni ja transkriptsiooni koosmõjul ilmnevat RNA sekundaarstruktuuri lõhkumist ei toimu. Esitatud mudeli tõepärasust kinnitavad katsed ribosoomi mutantidega, kus translatsiooni elongatsioon toimub aeglasemalt ning sel juhul väheneb proportsionaalselt ka operoni transkriptsioonitase. Aminoatsüül tRNA süntetaasid
annaabi.ee 
