elektrone punktidena, paigutades nad võimalikult "laiali" NB! Valentselektronide asetsemist s-ja p-orbitaalidel enamasti ei arvestata. Praktiline tegevusjuhend Lewise struktuurivalemite joonistamiseks Mõisted: Tsentraalne aatom -aatom, millega on seotud vähemalt kaks aatomit. Terminaalne aatom -aatom, millega on seotud parasjagu üks aatom. Juhend: 1. Loetakse kokku valentselektronide üldarv molekulis; 2. Joonistatakse molekuli "skelett", paigutades vesinikud sidemete otstesse (terminaalsetele asukohtadele), muud aatomid keskele (tsentraalsetele asukohtadele); 3. Molekulides, kus pole vesinikke, pannakse keskele tavaliselt aatomid, millel on võrreldes teiste aatomitega vähem elektrone väliselektronkihil; 4. Joonistatakse välja elektronid, mis moodustaksid elektronipaari; 5. Ülejäänud elektronid paigutatakse esmajärjekorras terminaalsete aatomite ümber, seejärel, niipalju kui võimalik, tsentraalsete aatomite ümber; 6
34. Kirjelda eukarüootse mRNA molekuliga toimuvad muutusi pärast transkriptsiooni lõppu ja translatsiooni algust. Eukarüootse pre-mRNA protsessimise jooksul toimub 3 peamist sündmust: (1) 5' capping 5' cap lisatakse vahetul pärast transkriptsiooni initsiatsiooni. Capping on iseloomulik vaid mRNAdele. Capping ensüüm seondub fosforüülitud RNAPolII CTD'ga. Ensüümi fosfotaasi aktiivsusega alaühik eemaldab ühe terminaalse fosfaatrühma. Seejärel lisatakse terminaalsetele fosfaatidele GTP, kaotades 2 protsessi käigus 2 GTP fosfaatrühma. Tulemuseks on 5'-5' trifosfaatne struktuur. Guaniini 7N asendis olevale lämmastikule kantakse üle metüülrühmad ning RNA 5' otsas paiknevate ribooside 2' oksügeenidele. (2) 3' lõikamine ja polüadenüülimine. Peaaegu kõik mRNAd sisaldavad järjestust AUAAA. Mis asub polü(A) sabast 10-35bp ülavoolu. Lõikamis- ja polüadenüülimis-spetsiifiline faktor (CPSF), mis koosneb neljast
subühikuks. Ribosoomid (70S/80S) moodustavad tuumakestes. Seal toimub valkude süntees (asuvad tsütoplasmas, Eukarüootse pre-mRNA protsessimise jooksul toimub 3 peamist sündmust: (1) 5' capping 5' cap lisatakse vahetult pärast transkriptsiooni initsiatsiooni. Capping on iseloomulik vaid mRNAdele. Capping ensüüm seondub fosforüülitud RNAPolII CTD'ga. Ensüümi fosfotaasi aktiivsusega alaühik eemaldab ühe terminaalse fosfaatrühma. Seejärel lisatakse terminaalsetele fosfaatidele GTP, kaotades 2 protsessi käigus 2 GTP fosfaatrühma. Tulemuseks on 5'- 5' trifosfaatne struktuur. Guaniini 7N asendis olevale lämmastikule kantakse üle metüülrühmad ning RNA 5' otsas paiknevate ribooside 2' oksügeenidele. (2) 3' lõikamine ja polüadenüülimine. Peaaegu kõik mRNAd sisaldavad järjestust AUAAA. Lõikamis- ja polüadenüülimis-spetsiifiline faktor (CPSF), mis koosneb neljast erinevast valgust, moodustab ebastabiilse kompleksi
FIJIVIRUS ORYZAVIRUS 3.4.2. Genoom Täielikult on sekveneeritud kaks viirust: RDV (12 segmenti) ja Nilaparvata lungens reovirus (NLRV, perekond Fijivirus, 10 segmenti). Segmentide struktuurid on mõlemal viirusel sarnased: - segmentidel on sarnased terminaalsed struktuurid; - kodeeriva ahela 5'-otsas on cap-struktuur, 3'-otsas puudub polü(A); - konserveerunud terminaalsetele järjestustele järgnevad igas segmendis segment- spetsiifilised inverteerunud kordusjärjestused (3-17 b); - suurem osa segmente kodeerib ühte valku; - 5'-mittekodeeriv järjestus on 18-63 b pikkune; - 3'-mittekodeeriv järjestus 93-492 b pikkune. 29 LIISI KINK
Lewise struktuurivalem on aine valem, milles valentselektronid on kujutatud ülaltoodud viisil. Keemilist sidet (elektronipaari) võib kujutada ka kriipsuga (-). Praktiline tegevusjuhend Lewise struktuurivalemite joonistamiseks Mõisted: Tsentraalne aatom - aatom, millega on seotud vähemalt kaks aatomit. Terminaalne aatom - aatom, millega on seotud parasjagu üks aatom. Juhend: · Joonistatakse molekuli ,,skelett", paigutades vesinikud sidemete otstesse (terminaalsetele asukohtadele), muud aatomid keskele (tsentraalsetele asukohtadele). Skelett kujundada võimalikult sümmeetriline; · Tsentraalaatomiks valida väikseima elektronegatiivsusega aatom (orgaanilistes ühendites süsinik); · Ühendada aatomid üksiksidemetega; · Ülejäänud elektronid paigutatakse esmajärjekorras terminaalsete aatomite ümber, seejärel niipalju kui võimalik, tsentraalsete aatomite ümber.