vastavalt rekombinatsioonikiirusele ajas. Tegin joonise lehele. r on rekombinatsioonisagedus ajas. 5. Kuidas mõjutab küütvalik (hitchhiking) heterosügootsust populatsioonides vastavalt neutraalsele teooriale? Küütvalik on protsess, mille kaudu alleeli sagedus võib tõusta, sest ta on seotud teise alleeliga, millele toimub positiivne selektsioon. Nii saavad esineda madalamad heterosügootsusastmed looduslikes populatsioonides. 6. Mis on luudvalik (selective sweep)? Aga mis on taustvalik (background selection)? Kas nad teevad ka midagi sarnast? Täesti neutraalses lookuses on palju mitmesugust varieeruvust. Kui aga tekib üks kasulik mutatsioon ühes liinis, siis hakkab valik soosima just seda haplotüüpi koos lähedalasuvate aheldunud lookustega. Ja üsna kiiresti see fikseerub. Teiste haplotüüpidega seotud varieeruvus antud lookuses seetõttu läheb populatsioonist kaduma. Taustvalik kahjulikud mutatsioonid tulevad esile juhuslikult
MCMC jooksutamist. 67. Mis on Bayesian Skyline Plot? (Lühidalt, üldiselt.) Võimaldab hinnata populatsiooni efektiivset suurust ja selle muutumist ajas. 68. Millise tarkvara abil saab hinnata, kas programmi BEAST Bayesi analüüs on õnnestunud/töötanud piisavalt kaua? Nimetage kaks asja, mida sel puhul selle tarkvara abil analüüsi logis vaadata? Valik 69. Mis on negatiivne valik ja taustvalik (background selection)? Milline on nende mõju populatsiooni geneetilisele mitmekesisusele? Negatiivne ehk puhastav valik eemaldab kahjulikke mutatsioone ja vähendab populatsiooni geneetilist mitmekesisust. Koos kahjulike mutatsioonidega eemaldab puhastav valik ka kahjulike mutatsioonidega aheldunud neutraalsed mutatsioonid. Taustvaliku tõttu väheneb populatsioonis neutraalne varieeruvus ja suureneb
1) stabiliseeriv- heterosügootide eelistamine vAA