d) Valgu 3D struktuuri tundmine 2. Mingi valgu tootmiseks transgeense organismi abil on otstarbekas sisestada meid huvitav transgeen: a) Tugeva konstitutiivse promootori kontrolli alla b) Tugeva reguleeritava promootori kontrolli alla 3. Millisteks suhteliselt universaalseteks vaheühenditeks konverteeritakse enamus mittehalogeenitud aromaatseid ühendeid mikroobse degradatsiooni käigus? Sealt edasi järgneb juba nende oksüdatiivne lagundamine atsetüülCoA-ks, suktsinaadiks, püruvaadiks ja atseetaldehüüdiks, mida enamus mikroorganisme suudab metaboliseerida. a) Protokatehuaadiks b) Bensoaadiks c) Fenooliks d) Katehooliks e) Tolueeniks 4. Valige järgnevast loetelust kaks põhilist meetodit võõr DNA sisestamiseks taimerakku transgeensete taimede saamiseks? a) Agroinfektsioon Agrobacterium tumefaciens-i abil b) Laser vahendatud geeniülekanne c) Liposoom vahendatud geeniülekanne
katalüüsib isotsitraadi dehüdrogenaas. Reaktsiooni käigus eemaldatakse isotsitraadi molekulist vesiniku aatomite paar, mis seotakse NAD +-ga ning eraldub üks atsetüülrühma süsinik CO2-na. Produktiks on α-ketoglutaraat, millest α-ketoglutaraadi dehüdrogenaasi toimel tekib suktsinüül CoA. Selle protsessi käigus eemaldatakse veel üks vesinikupaar, mis seotakse NAD + ning eraldub CO2. Suktsinüül CoA süntaasi toimel lagundatakse suktsinüül CoA suktsinaadiks ja koensüüm A-ks, millega kaasneb GDP fosforüülimine GTP-ks. Suktsinaadi dehüdrogenaas oksüdeerib suktsinaadi fumaraadiks. Selles reaktsioonis võtab vesinikepaari endale FAD. Fumaraat hüdratiseeritakse(!) fumaraasi toimel malaadiks, mis malaadi dehüdrogenaasi toimel oksüdeeritakse oksaalatsetaadiks. Seega on oksaalatsetaat nii tsitraaditsükli lähteühend kui lõpp-produkt. Elektronide ülekanne hapnikule hingamisahelas
sünteesitakse tsitraat. 2) Tsitraadi isomerisatsioon isotsitraadiks 3) isotsitraadi konverteerumine -ketoglutaraadiks a. Toimub teine oksüdatiivne dekarboksüülimine, mille tulemusel sünteesitakse suktsinüül-CoA, eraldub CO2 (väljub teine süsiniku aatom) ning toodetakse NADH 4) -ketoglutaraadi konverteerumine suktsinüül-koensüüm A-ks 5) Toimub suktsinüül-CoA konventeerumine suktsinaadiks a. Ainuke reaktsioon tsitaaditsüklis, mille käigus toodetakse energiarikas fosfaatside 6) Suktsinaadi konventeerumine fumaraadiks a. Toimub suktsinaadi dehüdrogeenimine annab fumaraadi ning tekib FADH2 b. Tsitraaditsükkel on seotud hingamisahelaga suktsinaadi kaudu 7) Fumaraadi konventeerumine malaadiks 8) Malaadi konventeerumine oksloatsetaadiks a
Enterobakteriaalsel käärimisel moodustuvad: laktaat, formiaat, suktsinaat, etanool, atsetaat, 2,3- butaandiool, CO2, H2. Suhkruid lagundatakse glükolüüsirajas. Produktide tekkel on võtmepositsioonil püruvaat, millest moodustuvad käärimisproduktid. Püruvaat võib enterobakteritel metabooluda 4 moel: 1) Redutseeruda piimhappe tekkega 2) Laguneda Pyrformiaatlüaasi reaktsioonis formiaadiks ja AcCoA-ks. 3) PEP võib karboksüüluda oksaalatsetaadiks ja viidakse üle suktsinaadiks. Osaleb membraanne forforüülimine. Pyrformiaatlüaasi süntees toimub ainult anaeroobsetes tingimustes. Anaeroobsetes tingimustes moodustub püruvaatdehüdrogenaasne kompleks ja toimub püruvaadi NAD-seoseline dekarboksüülimine AcCoAks ja selle edasine aeroobne katabolism tsitraaditsüklis. Enterobakteriaalsel käärimisel on 2 tüüpi: 1) Hapete segu teke iseloomulik püruvaadist atsetaadi jt hapete teke. 2) Butaandioolkäärimine tekivad neutraalsed produktid
Nitraadi vähesust signaliseerib NarP. 59 Fumaraatne hingamine. Anaeroobses tingimustes on fumaraadi reduktaas (QFR, frdABCD) üks membraaniseoselistest flavoproteiinidest, mida kasutatakse elektronide ülekandeks lõpp-akseptorile. Antud juhul on akseptoriks fumaraat. Fumaraadi reduktaas on väga sarnane suktsinaadi dehüdrogenaasile, kuid viib läbi vastupidist reaktsiooni, redutseerib fumaraadi suktsinaadiks. Anaeroobses keskkonnas E. coli kasutab eelistatult esmaseks dehüdrogenaasiks NDH-I ning terminaalseks reduktaasiks fumaraadi reduktaasi ning elektronide ülekandjaks menakinoon 8. Fumaraadi reduktaas koosneb neljast subühikust, on flavoproteiin ning sisaldab Fe-S-klastrit, hädavajalik anaeroobseks hingamiseks kui energia- ja C- allikaks on glütserool või fumaraat. Operonilt on transkriptsioon represseeritud
annaabi.ee 
