Osadel juhtudel on näidatud, et mRNA-d 3´otsast stabiliseeriva toimega REP järjestuses. Translatsioon RBS-i maskeeriv sekundaarstruktuur tekib mRNA enda järjestuse baasil. mRNA translatsiooni aktiveerib regulatoorne RNA, valk või temperatuuri tõus, mis harutab juuksenõela lahti ja vabastab RBS-i. Translatsiooni initsiatsiooni pärssivate sekundaarstruktuuride kadumine kõrgemal temperatuuril. Kuumashoki sigma faktori RpoH mRNA muutub transleeritavaks kõrgemal temperatuuril. Translatsiooni initsiatsiooni pärssimine antisens-RNA abil micF on iseseisva geeni poolt kodeeritud antisens-RNA, mis paardub endale osaliselt komplementaarse mRNA 5' otsaga. micF RNA on translatsiooniline repressor. micF paardub ompF (kodeerib välismembraani valku F) mRNA RBS-i ja initsiaatorkoodonit AUG sisaldava alaga, blokeerides ompF geeni translatsiooni. Need
regulaator (näiteks cAMP retseptorvalk CRP e. CAP). Globaalse regulatsiooni kirjeldamiseks on võetud kasutusele veel mõiste stimulon. Stimuloni kuuluvad geenid, operonid, regulonid ja modulonid, mille tööd mõjutab üks ja sama keskkonnastiimul. Samasse stimuloni kuuluvate regulatoorsete üksuste tööd kontrollivad erinevad regulaatorid. Näiteks temperatuuri tõusu korral aktiveerub Htp (RpoH) regulon ja P-nälja puhul PhoB regulon, kuid lisaks nendesse regulonidesse kuuluvatele geenidele aktiveeruvad veel paljud teised. Näiteks P-nälja puhul on indutseeritud 145 erinevat valku, millest ainult 38 on kodeeritud PhoB reguloni kuuluvate geenide poolt. Nälja korral lähevad rakud statsionaarsesse faasi ja neis indutseeritakse ka RpoH regulon (kuumashokk), Lrp regulon (Lrp aktiveerib aminohapete biosünteesi geenid ja represseerib aminohapete katabolismi
promootorjärjestust. Kui leiti, siis polümeraas ei dissotseeru, aga sigmafaktor teeb seda. Erinevad sigmafaktorid tunnevad ära erinevaid DNA järjestusi (tagab promootori ja ahela spetsiifika, nõrgendab RNA polümeraasi seondumist). Kiire protsess. RNA polümeraasi põhiensüüm võib ka ilma sigmafaktorita kompleksi moodustada (aga väga väikeses osas). Põhiline on sigma 70. rpoD ⁞ 70 kD ⁞ üldine ⁞ TTGACA (-35) ⁞ 16-18 bp ⁞ TATAAT (-10) rpoH ⁞ 32 kDa ⁞ heat shock ⁞ COCTTGAA ⁞ 13 – 15 bp ⁞ COCGATNT rpoN ⁞ 54 kDa ⁞ lämmastik ⁞ CTGGNA ⁞ 6 bp ⁞ TTGCA Initsiatsioon RNA polümeraas + sigma subühik → kiire protsess DNA otste lahtisulamine → avatud kompleksi moodustamine, tunduvalt aeglasem, kui esimene protsess (miljard x) esimese 10 nukleotiidi süntees → suhteliselt kiire üleminek initsiatsioonilt elongatsioonile → kõige aeglasem + edasiste nukleotiidide süntees. Promootori puhastamine
annaabi.ee 
