peetakse ensüümi koostisosaks. E. coli RNAP holoensüüm (täisensüüm) koosneb neljast erinevast polüpeptiidist (valgust), millest üks on kahe koopiana. Holoensüümi erinevaid osi tähistatakse kreeka tähtedega. Holoensüümi komponendid ja neid kodeerivad geenid on toodud alljärgnevas tabelis: Escherichia coli RNA polümeraasi subühikud ja nende geenid geen subühiku tähis molekulmass rpoA (alfa) 40 kDa rpoB (beeta) 156 kDa rpoC ' (beeta prim) 160 kDa rpoD (sigam) 32-90 kDa Holoensüümis on kaks subühikut, üks , üks ' subühik ja üks sübühik (2') molekulmassiga 428-486 kDa. Transkriptsiooni elongatsiooni viib läbi põhi- e. tuumikensüüm ('core enzyme' ingl. k.), milles puudub subühik, seega 2'.
kui sünteesitav mRNA on + ahel – kodeeriv ahel. – ahel on komplementaarne ahel, mille järgi sünteesitakse. See transkrptsiooni initsiatsiooniprotsess on prokarüootides küllaltki oluline. RNA polümeraasid Prokarüootidel on 1 aktiivne RNA polümeraas, eukarüootidel on neid 3. Prokarüootne RNA polümeraas. E. Coli RNAP holoensüüm – täisensüüm – koosneb 4- st erinevast polüpeptiidist (valgust), millest üks on kahe koopiana. subühikud on α – geen rpoA; β subühik, geen rpoB, β’, rpoC; sigma, rpoD. Holoensüümis on kaks α subühikut, üks β, üks β’ ja üks sigma. Molekulmass 428-486 kDA. Transkriptsiooni elongatsiooni viib läbi põhi- e. tuumikensüüm – core enzyme, milles puudub sigma subühik, seega olemas α, β, β’. sigma subühik osaleb ainult translatsiooni initsiatsioonil suunates põhiensüümi seondumist promootoriga. Kuna on mitut tüüpi promootoreid, siis on vastavalt ka mitu sigmafaktorit. Põhiline on sigma
Seondudes kuuenda subühikuga, - subühikuga, moodustub RNAP holoensüüm, mis on võimeline initsieerima transkriptsiooni. RNAP ' subühik (rpoC) sisaldab osa aktiivtsentrist, mis sünteesib RNA-d, see subühik vastutab ka DNA-ga ja äsjasünteesitud RNA-ga mittespetsiifilise seondumise eest. RNAP subühik (rpoB) sisaldab ülejäänud aktiivtsentrit, mis on RNA sünteesiks vajalik ning osaleb samuti DNA ja RNA-ga mittespetsiifilises seondumises. RNAP subühik (rpoA) on RNAP kahe koopiana, N-terminus vastutab RNAP assambleerumise eest ning C-terminus on oluline UP- elementidega seondumiseks ning regulaatorvalkudega seondumiseks. RNAP väikseim -subühik (rpoZ) on oluline RNAP assambleerumisel, aitab '- subühikul seonduda 2 subühikutega ning stabiliseerib RNAP-d. Lisaks assambleerimisele, osaleb -subühik ppGpp vahendatud transkriptsiooni regulatsioonis. RNAP, millel puudub -subühik, on ppGpp suhtes tundetud ega vahenda globaalse alarmooni regulatsiooni