keskkonda (lac operon); ehk aktiveeritakse siis, kui vaja läheb REPRESSEERITAVAD GEENID – inaktiveeruvad liigse produkti hulga korral keskkonnas (trüptofaani operon) KRÜPTILISED GEENID – neid ei transkribeerita kunagi, promootor muteerunud 14. Lac operon on indutseeritav operon: ehk AKTIVEERUB SUBSTRAADI OLEMASOLUL 15. Mida tähendab, et trüptofaani operon on represseeritav? Trüptofaani süntees: represseeritav transkriptsiooni süsteem (lac operoni peegelpilt) Repressor muutub aktiivseks koos trüptofaaniga. Kui rakus kättesaadav trüptofaan saab otsa, siis trüptofaan eraldub repressori küljest ja rakk hakkab taas trüptofaani tootma. 16. Millest tuleneb mikroobide fenotüübiline muutlikkus? Modifikatsioonid tekivad keskkonnatingimuste kohastumuslike muutustena. Ei kandu järglastele. Võivad olla näiteks: * mikroobirakkude suuruse muutused *pesade pigmentatsioon
Tähtis ka DNA metülatsiooni tase neis kudedes kus ei ekspressiooni ei toimu on geenid (uinuvas olekus geenid) harilikult rohkem metüleeritud. Metüleerimine muudab geenide struktuuri ja seega transkriptsiooni toimumist. CG nukleotiidipaaris saab metüleerida tsütosiini (tsükli viiendast positsioonist) Enamus bakteriaalseid geene on organiseeritud operonidesse, mida saab korraga indutseerida ja represseerida. Indutseeritav süsteem näiteks lac-operon, represseeritav süsteem näiteks trüptofaani süntees Paljudel bakterite aminohappe sünteesi operonidel on nn "nõrgendav piirkond" (attenuator control). Nõrgendav piirkond asub operoni ja esimese struktuurvalgu vahel: kui esimest peptiidi saab kohe sünteesida (st aminohapet on piisavalt) võtab ahel sellise kuju, et edasine süntees termineeritakse. Kui süsteem peab ootama, võtab ahel teise kuju ning sünteesib mRNA lõpuni Lac-operoni transkr. Indutseeritav süsteem
ArcB ja ArcA defosforüleerimine. Mõlemaid reaktsioone teostab ArcB. Kahe-komponendiline Arc süsteem kontrollib mitmete metaboolsete radade tööd: 1) tsitraaditsükkel 2) glüoksülaadi rada 3) terminaalne elektronide transport molekulaarsele hapnikule aeroobne hingamine 4) rasvhapete degradatsioon ArcA võib käituda nii aktivaatorina kui ka repressorina. Näiteks tsütokroom d operon (cydAB) on fosforüleeritud ArcA poolt aktiveeritav, tsütokroom o operon cyoABCDE aga represseeritav. Paljud arc moduloni kuuluvad geenid on ArcA poolt represseeritavad. Anaeroobse hingamise regulatsioon Aeroobsetes tingimustes ja olukorras, kus kataboolse repressiooni mõju on nõrk, suunatakse püruvaat TCA tsüklisse. Määravaks on siin püruvaadi dehüdrogenaasi ekspressioonitase. Selle ensüümkompleksi süntees on represseeritud anaerobioosis ja kompleks ise inhibeeritav NADH poolt.
(aerobic respiration control). Kahe-komponendiline Arc süsteem kontrollib mitmete metaboolsete radade tööd: 1) tsitraaditsükkel 2) glüoksülaadi rada 3) terminaalne elektronide transport molekulaarsele hapnikule aeroobne hingamine 4) rasvhapete degradatsioon ArcA võib käituda nii aktivaatorina kui ka repressorina. Näiteks tsütokroom d operon (cydAB) on fosforüleeritud ArcA poolt aktiveeritav, tsütokroom o operon cyoABCDE aga represseeritav. Paljud arc moduloni kuuluvad geenid on ArcA poolt represseeritavad. ArcB on sensor-kinaas ja ArcA signaalile vastav (response) regulaator. ArcB autofosforüleerib ennast vastusena stiimulile ja seejärel toimub ArcA fosforüleerimine. Stiimuliks on mingi metaboliidi redutseeritud vorm (näiteks NADH, D-laktaat, atsetaat). Kui stiimul keskkonnast kaob, toimub ArcB ja ArcA defosforüleerimine ArcB poolt Püruvaadi metabolismi regulatsioon