geenid grupeeritud operoni Kromosomaalne DNA Nimetatakse ka bakteri kromosoomiks. E. coli, genoom 4700 kbp pikk (umbes 1400 µm), mass on 4.4×10-15 g., sisaldab 3...6 × 106 nukleotiidipaari (bp) ühe geeni "pikkus" on umbes 1000 nukleotiidi-paari. Bakterite genoomne DNA haploidne, tsirkulaarne, kaheahelaine, singulaarne. Genoom - kodeerib mitu tuhat polüpeptiidi (~360 aminohapet). Ekstrakoromosomaalne DNA - plasmiid § Diskreetsed, ekstrakoromosomaalsed replikonid. § Suurus varieerub - 5 ×106 - 100 ×106 daltonit. § Enamasti kodeerib bakteritele mittevitaalseid omadusi. § Replikatsioon genoomist sõltumatult. § Enamus plasmiide supercoil'ed, tsirkulaarsed, kaheahelaline DNA, mõned ka lineaarsed plasmiidid - Borrelia, Streptomyces § Pole elutegevuseks vajalik, kuid võib anda evolutsioonilise eelise Plasmiidide poolt determineeritavad omadused § Paljud plasmiidid on vastutavad mitmete meditsiinilist tähendust omavate omaduste eest:
aluspaaride vahel Topoisomeerid - ensüümid, mis leevendavad torsiooni jõude sinna katkeid tehes (et nö pinge välja lasta). Kõrvaldab superspiraale ja soodustab DNA kaksikahela lahtikeerdumist. 16. Mis on replikon? Replikon on replitseerunud DNA-segment, mis on lähtunud ühest alguspunktist (koht, mis on läbi teinud replikatsiooni ehk koht, kust algab kaksikahelalise DNA lahtiharutamine). Hiljem liidetakse kõik replikonid tagasi kokku. Replikatsiooni ajal on inimese kromosoomides kuni 10 000 replikoni. 17. Kirjelda replikatsioonikahvli liikumist Struktuur, mis moodustub sünteesilookuse juures, kus kaheahelaline DNA läheb üle üheahelaliseks, kannab nimetust replikatsioonikahvel. Replikatsioonikahvel liigub ahela sünteesiga samas suunas, alati suunaga 5’-3’ ehk nukleotiide lisatakse ainult kasvava ahela 5’ otsa. Replikatsioonikahvli ette tekib positiivne superspiraal, kahvli taha tekib negatiivne
initsiatsiooni. Madal cdk kontsentratsioon, toimub Pre-R moodustumine, kui aktiivsus on väga kõrgeks tõusunud, siis inhibeerib pre-RC moodustumist. Kõrge cdk aktiivsuse tasemel valke fosforüleeritakse (inhibeerib) ja olemasolevad replikatsiooni kompleksid saavad lõpuni sünteesida. Pärast M-faasi – cdk-d pole. S-faasis on tase kõrge (DNA süntees). G1 faasis tekivad. G2 faasis cdk lagundatakse. Replikatsioon lõpeb ter saidis. Ter saidis replikonid lahutab Topoisomeraas 2 (on tekkinud kaks plasmiidi, Topo 2 lahutab nad teineteisest). Rõngaskromosoom, tekivad konkatemeerid (DNA rõngasmolekulid, mis on omavahel ruumiliselt kovalentselt seotud). Topoisomeraas 2 – tekitab DNA-s kaheahelalisi katkeid. Kontaktemeerid lahkuvad. Mahajääva ahela lõpust RNA praimeri lagundamisel DNA polümeraas ei saa seostuda, sest pole DNA-d kuhu seostuda. ― 5’ siin oli praimer ― 3’ et DNA ahelad ei lüheneks on telomeerid ahelate otstes