nukleaaside poolt atakeeritav või mitte. 6. RNA sekundaarstruktuuride osa geeniregulatsioonis. Transkriptsiooni terminatsioon Transkriptsiooni elongatsioon ei toimu ühtlase kiirusega. RNA polümeraas võib transkriptsiooni käigus peatuda (ingl. k. "pausing") juuksenõelastruktuuride moodustumise tõttu vast-sünteesitud mRNA-s. Tänu moodustuvatele sekundaarstruktuuridele tekib võimalus transkriptsiooni regulatsiooniks läbi elongatsiooni ja terminatsiooni mõjutavate faktorite. NusA on multifunktsionaalne elongatsioonifaktor, mis stimuleerib teatud tüüpi pausingut (näit. trp ja his operonide sekundaarstruktuuridel) ja Rho-sõltumatut transkriptsiooni termineerumist. Indutseerib anti- terminatsiooni Rho-sõltuvatelt terminaatoritelt. Antiterminatsiooni kompleksis teiste faktorite juuresolekul takistab termineeruva sekundaarstruktuuri teket. Attenuatsioon Parasjagu sünteesitavalt mRNA-lt algab kohe ka translatsioon, see võimaldab reguleerida transkriptsiooni
Fosforüleerimata BglG vorm aga dimeriseerub ja seondub RAT-ile, mille tulemusena transkriptsioon ei termineeru. Antiterminatsioon RNA polümeraasi modifitseerimise kaudu a) Faag lambda lüütilise tsükli geenide transkriptsioon RNA polümeraasi modifitseerimine faag lambda N valgu poolt võimaldab transkribeerida faag lambda lüütilise tsükli geene. Antiterminatsioonil osalevad ka E. coli valgud NusA, NusB, NusE (ribosoomi valk S10) ja NusG. Antiterminatsioonikompleks moodustub promootoripoolsel RNA järjestusel (nut sait) ning ei lase rho-valgul seonduda. Selleks interakteerub NusA otseselt antiterminatsioonivalguga N ning RNA polümeraasi CTD seondub NusA-ga. b) Ribosomaalse rRNA operonide rrn transkriptsioon rrn operonid sisaldavad faag lambdale sarnast nut elementi (boxA, boxB). Erinevus on selles, et lambda
cis-elemendid on nut - saidid. cis-elemendid toimivad antiterminatsioonifaktorite abil. antiterminatsiooniboksid: box A – primaarstruktuuride element. 53 box B – RNA sekundaarstruktuuri element. Antiterminatsiooni cis-elemendid – nut – sait. Antiterminatsiooni järjestuselemendid töötavad RNA tasemel. RNA polümeraas alustab ja mingi hetk terminatsiooni saidid vabastavad antiterminatsioonifaktorid. Antiterminatsioonifaktorid: NusA, NusB, NusC, NusD, NusE. Seostuvad kindla RNA kindlate järjestustega. Need faktorid seonduvad box A ja box B-ga. RNA polümeraas on jõudnud boxidest üle, faktorid on seondunud RNA-ga ja seonduvad ka RNA polümeraasiga. Ülejäänud RNA pungub välja RNA-st. 5’ otsa hoitakse kinni ja toimub väljapungumine (otsad hoitakse lähestikku). Aitavad ruumilist struktuuri tekitada. Lõpuks on kaks väga tugeva operoni lõpus rho sõltumatu terminatsioon. Rho
annaabi.ee 
