• Operaator on struktuurigeenide avaldumist kontrolliv operoni osa. • Polütsistroonne RNA on opeonilt sünteesitud RNA-molekul. • Promootor on nukleotiidijärjestus, millega seonduvad transkriptsioonifaktorid ja RNA polümeraas, et initsieerida transkriptsiooni. • Transkriptsiooni ühik on DNA osa, mida transkribeeritakse RNA molekuliks. • enhancer on lühike DNA ala, mis seob aktivaatoreid (valgud), initsieerib transkriptsiooni läbi mediaatorkompleksi. Enhancer alade tuvastamiseks kasutatakse linker–skaneeritud, mutatsioon analüüs/geelelektro-foreesi ja autoradiograafiat, footprinting. • Transkriptsiooni faktor on valk, mis seondub spetsiifilistele DNA järjestustele, kontrollides see läbi mRNA molekulide transkriptsiooni kiirust DNA-lt. • RNA polümeraas on ensüüm, mis transkriptsiooni käigus sünteesib uue RNA molekuli, kasutades matriitsina DNA-d.
reinitsiatsiooni uute RNA-polII molekulidega. 19. Mida tähendab väljend "kasutades lacZ reporterina" ja mis analüüsi- meetodiga on tegu? Transgeenne analüüs. a. Reportergeen viiakse uuritavasse rakku... 20. Defineeri enhancer ja loetle enhanceri omadused. Missuguseid analüüsi-meetodeid kasutatakse enhanceralade tuvastamiseks? a. Enhancer lühike DNA ala, mis seob aktivaatoreid (valgud), initsieerib transkriptsiooni läbi mediaatorkompleksi. b. Tuvastamiseks kasutatakse linkerskaneeritud, mutatsioon analüüs/geelelektro-foreesi ja autoradiograafiat, footprinting. 21. Nimeta vähemalt 3 üldist bioloogilist protsessi, kus enhancerite aktiivsusega kontrollitakse geen ekspressiooni tasemeid? a. Splaissing, translatsioon, transkriptsioon. 22. Kirjelda eukarüootse mRNA molekuliga toimuvad muutusi pärast transkriptsiooni lõppu ja translatsiooni algust. a
Mediaator mõjutab otseselt transkriptsiooni preinitsatsiooni kompleksi kokkupanekut. On leitud, et üks mediaatori alaühik võib funktsioneerida kui promootori hüperatsetüleerituse hoidja (hüperatsetülatsioon initseerib GTF'de seondumist TATA-boxile). Arvatakse, et mediaatori üksikud alaühikud interakteeruvad spetsiifiliste aktivatsioonidomäänidega. Seega indutseerivad mitmed aktivaatorid läbi mediaatorkompleksi ühelt promootorilt transkriptsiooni samaaegselt. 12. PolI ja PolIII-sõltuv transkriptsioon. Mille poolest need erinevad PolII-sõltuvast transkriptsioonist. Iga kolmest RNAPol'st vajab oma polümeraasspetsiifilisi GTF'e ning tunneb ära erinevaid DNA järjestusi. PolI ega PolIII ei vaja erinavalt PolII'st transkriptsiooni initsiatsiooniks ATP-energiat. RNAPolI-sõltuv initsiatsioon. Initsiatsiooniks absoluutselt vajalik on core element (ulatub -40bp kuni +5bp).
7 AH, millest 3 on Ser). TBP seondumine muudab DNA kuju. Transkriptsioon muudab DNA topoloogiat - DNA on nii pikk, ei saa ümber telje pöörelda. Kui teha transkriptsiooni mull, siis see soodustab vindi teket. Lk=Tw+Wr-. Mulli ees positiivsed ja taga negatiivses supervindid. Neid eemaldavad ja reguleerivad topoisomeraasid. Mediaatori vahendused toimuv transkriptsiooni initsiatsioon Inimese geenide transkriptsioon algab peaaegu alati mediaatorkompleksi vahendusel. Seonduvad üldised transkriptsioonifaktorid. Lisaks seonduvad aktivaatorvalgud – spetsiifilised ja on igal geenil erinev kombinatsioom Mediaatorkompleks – suur kompleks, mis seondub transkriptsiooni aktivaatoritega ja on 2-domäänilised valgud. Üks domään seondub DNA-ga, teine mediaatoriga. Teisel üks DNA-ga, teine aga kromatiini ümbermodelleerimise kompleksiga. Keeruline valgukompleks. Lisaks on spetsiaalne TF, mis koosneb kahest moodulist. Üks domään
annaabi.ee 
