5 nm). This groove fits well the 20 Å (2 nm) double strand of DNA. The 55 Å (5.5 nm) length can accept 16 nucleotides. When not in use RNA polymerase binds to low affinity sites to allow rapid exchange for an active promoter site when one opens. RNA polymerase holoenzyme, therefore, does not freely float around in the cell when not in use. 12. Joonista tüüpilise PolII promootori struktuur ja kirjelda faktoreid, mis sinna transkriptsiooni initsiatsiooni käigus seovad. Mediaatorkompleks ja selle tähtsus. 5'......TATAAA...3' TATAbox TATAboxile: · Seondub TFIID (TBP kaudu) · TFIID'le seondub TFIIA ülavoolu · TFIIB seondub alavoolu TFIID'le · Seondub RNA-polümeraas II kompleks TFIIF-ga · Seonduvad tekkinud kompleksiga TFIIE ja TFIIH Mediaatorkompleks transkriptsiooni koaktivaator, seostub RNA-polII C-
Selle energia abil keerataksegi START-saidi piirkonnas DNA dupleksi lahti. (TFIIH ühe teise sub-kompleksi roll on fosforüleerida RNA polümeraasi suurima subühiku C-terminaalset domääni (CTD), mis on vajalik polümeraasi vabanemiseks PIC-ilt (pre-initsiatsiooni kompleks) ning transkriptsiooni üleminekul elongatsioonifaasi). 3 11. Joonista tüüpilise PolII promootori struktuur ja kirjelda faktoreid, mis sinna transkriptsiooni initsiatsiooni käigus seovad. Mediaatorkompleks ja selle tähtsus. Transkriptsiooni initsiatsiooni käigus (siin kirjeldatud TATA-box tüüpi promootoril) seondub TATA-box järjestusele kõigepealt TFIIA ja TFIID (milles on TBP subühik). Seejärel lisandub ühtse sündmusena holoensüüm (mis koosneb PolII, TFIIB, TFIIF, TFIIH, TFIIE ning multivalksest mediaator- kompleksist). Mediaator on assotseerunud mittefosforüülitud PolII CTD-ga. Vahepeal on UCE
RNA polümeraasi spetsiifilist seondumist geeni promootoriga. Erinevad sigma faktorid aktiveeritakse vastuseks erinevatele keskkonna tingimustele. Iga RNA polümeraas sisaldab täpselt ühte sigma- faktorit. Operon on geneetilise materjali funktsionaalne ühik, mis koosneb kimbust geenidest, mis on kõik allutatud ühele regulatoorsele signaalile või promootorile. Geenid transkribeeritakse koos mRNA ahelasse. Mediaatorkompleks moodustab molekulaarse silla aktivatsioonidomäänide ja RNAPolII vahel. Mediaator mõjutab otseselt transkriptsiooni preinitsatsiooni kompleksi kokkupanekut Inteiin on valgu segment, mis on võimeline iseennast välja lõikama ja järele jäänud valguosade vahele sünteesima peptiidsideme. RNAPolI-sõltuv initsiatsioon. Initsiatsiooniks absoluutselt vajalik on core element (ulatub -40bp kuni +5bp). Initsiatsioonikompleksi moodustumine algab multimeerse UAF (ülavoolu-aktiveeriv-
Kui teha transkriptsiooni mull, siis see soodustab vindi teket. Lk=Tw+Wr-. Mulli ees positiivsed ja taga negatiivses supervindid. Neid eemaldavad ja reguleerivad topoisomeraasid. Mediaatori vahendused toimuv transkriptsiooni initsiatsioon Inimese geenide transkriptsioon algab peaaegu alati mediaatorkompleksi vahendusel. Seonduvad üldised transkriptsioonifaktorid. Lisaks seonduvad aktivaatorvalgud – spetsiifilised ja on igal geenil erinev kombinatsioom Mediaatorkompleks – suur kompleks, mis seondub transkriptsiooni aktivaatoritega ja on 2-domäänilised valgud. Üks domään seondub DNA-ga, teine mediaatoriga. Teisel üks DNA-ga, teine aga kromatiini ümbermodelleerimise kompleksiga. Keeruline valgukompleks. Lisaks on spetsiaalne TF, mis koosneb kahest moodulist. Üks domään tunneb ära DNA järjestuse ja teine seondub mediaatorkompleksiga. TF terminatsioonid määravad geeni avaldumise. Valkkompleks, mis remodelleerib kromatiini. Histoone
annaabi.ee 
