struktuuride erinevuste mõju hapnikutranspordile. Hapnik seotakse ligandina Fe-le. Müoglobiini hapnikuga seostumata Fe2+ ioon ulatub heemi tasapinnast välja. O2 sidumine tõmbab Fe2+ iooni heemi tasapinda. Fe ioon tõmbab oma His F8 ligandi endaga kaasa. F heeliks muudab oma asendit. Hemoglobiini allosteeriline käitumine seisneb selles, et ainult ahelad on võimelised siduma O2 T- olekus (-ahelal on see steeriliselt takistatud). Hapniku sidumisel tulemusena -ahelatele toimuvad konformatsioonimuutused teevad alles võimalikuks O2 sidumine ahelatele. Hemoglobiini hapnikuga seostumata Fe2+ ioon ulatub heemi tasapinnast välja. O2 siduminel Fe2+ tõmmatakse porfüriini tasapinda. Sellega tõmmatakse kaasa His F8 ja kogu 8. heeliks. See nihe kandub üle subühikute kontajtpindadele, mille tulemusel õhutakse ahelate vahelised soolasillad.
kogu metaboolse raja kiirus. Selliste võtmeensüümide poolt katalüüsitavate protsesside statsionaarne olek on kaugel nende tasakaaluolekust. Ensüümide aktiivsuse regulatsioon: · Kovalentne modifitseerimine Pöörduv (fosforüülimine) Mittepöörduv (limiteeritud proteolüüs, metüleerimine) · Mittekovalentsed regulatsioonimehhanismid Spetsiifilised aktovaatorid-inhbiitorid Produktpidurdus Keskonnatundlikud konformatsioonimuutused Kooperatiivsus ja allosteerika · Kompartmelisatsioon · Iga ensüüm paikneb kindlas raku piirkonnas või struktuuris See tagab ensüümreaktsioonide eraldatuse ja kindla järjestuse · Substraadi ja kofaktorite kontsentratsioon Ensüümid - katalüütiliste omadustega valgud (lihtensüümid) või valkude kompleksid (liitensüümid). Ensüümid osalevad peaaegu kõikides biokeemilistes reaktsioonides elusorganismides
Fe'le kuuenda ligandina. Hapniku seondumisel Mb konformatsioon muutub (Fe alul heemi tasapinnast väljas, hapniku lisandumisel tõmbab see Fe tasapinda ja Fe tõmbab endaga kaasa kogu heeliksi), kuid Mb puhul ei oma see suurt tähtsust. Kui Hb käituks nagu Mb, siis vabaneks kapillaarides väga vähe hapniku. Hb sigmoidne (kooperatiivne) hapniku sidumiskõver tee võimalikuks efektiivse hapnikuvahetuse. Hapniku sidumise tulemusena alfa-ahelatele toimuvad konformatsioonimuutused teevad alles võimalikuks hapniku sidumise beeta-ahelatele. Hapniku 2+ sidumisel (Fe tasapinda tõmbamisel) katkevad kõik soolasillad Hb subühikute vahel. X MOLEKULAARMOOTORID 1. Motoorvalgud e molekulaarmootorid on valgud, mis transformeerivad ATP-energia liikumisenergiaks. ATP
vähendab Vmax väärtust. LIISI KINK 29 BIOKEEMIA test I Segatüüpi mittekonkurentne inhibeerimine. I sidumine ensüümile mõjutab substraadi sidumist ensüümi poolt. Sidumistsentrid asuvad lähestikku või leiavad aset konformatsioonimuutused. Inhibiitori lisamisel muutuvad mõlema telje lõigud kui sirge tõus muutuvad nii Km kui Vmax väärtused. Ebakonkurentne inhibeerimine inhibiitor (I) seondub aiult ES, mitte E. Bisubstraatsete ensüümireaktsioonide põhiskeemid. Graafilised väljendused koordinaatides 1/v versus 1/A substraadi B kontsentratsiooni suurenemisel. Enamik reaktsioone (nii in vivo kui in vitro) kulgeb rohkem kui ühe substraadi osavõtul ning
koensüümide ahela, et moodustada prootonigradient läbi mitokondri sisemembraani. Protsessid toimuvad mitokondri sisemembraanis või selle pinnal. Elektronid loovutatakse negatiivsema redokspotentsiaalisega reaktsiooni poolt ning võetakse vastu positiivsema redokspotentsiaaliga reaktsiooni poolt. Mida suurem on ühendi redokspotentsiaal, seda tugevamalt saab teda taandada. Prootonigradient Elektronide transpordist saadav energia moodustab prootongradiendi, mis kutsub esile ATP süntaasi konformatsioonimuutused, mille tulemuseks on substraadi sidumine, ATP süntees ja produkti vabanemine. Prootongradiendi puudumisel ei saa sünteesitud ATP ensüümilt vabaneda. Mehhanismi juures ilmneb katalüütiline kooperatiivsus. Kui elektronid pärinevad NADH'lt, tekib ühe NADH kohta 2,5 ATP. Kui elektronid pärinevad FADH 2'lt, tekib ühe FADH2 kohta 1,5 ATP. Suhe P/O näitab, mitu ATP molekuli sünteesitakse iga ½ O2 taandamisel H2O'ks. ATP kogusaagis ühest glükoosi molekulist
mitokondri sisemembraani. c) Tsütokroomid Tsütokroom C on vesilahustuv elektronide kandja valk ja paikneb membraanidevahelises ruumis. Tsütokroomid on ühe-elektroni ülekande agendid. d) ATP süntaas Roteeruv molekulaarmootor, mille abil toimub ADP fosforüleerimine prootonigradiendi juuresolekul. F1-l on kolm omavahel interakteeruvat kuid eristatud aktiivtsentrit. Elektronide transpordist saadav energia moodustab prootonigradiendi, mis kutsub esile ATP süntaasi konformatsioonimuutused. Selle tulemuseks on substraadi (ADP) sidumine, ATP süntees ja produkti vabanemine. 2. Esitage mitokondri joonis (lõige) ja kirjeldage selle põhjal mitokondri ehitust. Imetaja rakus 800-2500 mitokondrit. Pikkus - 0,5 kuni 2 m. Läbimõõt - 0,3 kuni 0,5 m Kahe membraaniga (välismembraan, sisemembraan) bakteriaalset päritolu organell. Membraanide vahel on membraanidevaheline ruum. Sisemembraanist edasi asub