järeltulijad on tänaseni säilinud. Geenitriivi tagajärjel osad liinid jäävad, teised kaovad.Lõpuks jääb alles ainult 1 liin, teised kaovad. Liinide sorteerumise tulemusel muutuvad alampopulatsioonid üksteisest erinevaks. Ei; töötab minevikust kuni viimase õhise eellase leidmiseni. 3. Selgita kahe liini koalestseerumist ja oodatavat koalestsentsiaega sõltuvalt populatsiooni efektiivsest suurusest! Natalja Selleks, et selgitada kahe liini koalestseerumist, tuleb teha koalestseerumise mudel, millega saab ennustada koalestsentsi aegu ja seda, kui varieeruvad nad on. Selleks, et teada oodatavat aega koalestseerumiseni, on vaja teada koalestseerumiste sagedust, mis on üksüheses vastavuses geenitriivi kiirusega ehk populatsiooni efektiivse suurusega. W-F populatsioonis on see N=Ne. Sageduse ja ooteaja vahel esineb pöördvõrdeline seos – kui sagedus on 1/10-le, siis ooteaeg on 10 aastat. Koalestsentside sagedus= tõenäosus, et kahel geenil on eelmises
rohkem hiljutise lahknemisega liigipuude korral. Saab nähtavamaks, kui iga liiki esindab mitu indiviidi. Ehk ühes liigis mitme geeni järglased. 57. Kirjeldage mitmele populatsioonile kohaldatud koalestsentsi mudelit (multispecies coalescent model). Milleks seda mudelit kasutada saab? Kohaldab koalestsentsi mudeli ahelpopulatsioonidele, mida ühendab evolutsioonipuu. Mudel võimaldab arvesse võtta erinevatest liikidest pärit geeniliinide koalestseerumise sügavamas minevikus kui neid geene kandvate liikide lahknemine. Võimaldab hinnata geenipuu tõenäosusjaotust antud liigipuu korral. Koalestsentsi kiirus taastatakse algseks kui liinidest tekib uus liik. Geenid jagunevad ennem liike. 58. Tooge näiteid molekulaarse fülogeneetika rakendustest. Valkude evolutsiooni uurimine – nt kofeiini biosünteesi konvergentne evolutsioon Kladistika – fülogeneetiline süstemaatika.
väheneb 1 võrra) keskmiselt aja t(i) jooksul: Generatsioonides t(i) = 2*2N/(k*(k-1)) 2N ühikutes t(i) = 2N/(k*(k-1)) Keskmine TMRCA ehk puu sügavus: Generatsioonides: 2N ühikutes: TMRCA = 2*(1-1/k) Kui koalestsentsi tõenäosus igas põlvkonnas on 1/2N, siis keskmiselt tuleb oodata 2N põlvkonda kuni 2 liini koalestseeruvad. Koalestsentsiaegade standardhälve on samuti 2N põlvkonda. Koalestseerumise aeg on ennustatav suurte veapiiridega. Jaotuse hajuvus on suur. Koalestsentsiajad jaotuvad eksponentjaotuse/geomeetrilise jaotuse järgi (ja sellepärast ongi suur hajuvus). Ehk mida sügavamale seda suurem hajuvus. 5. Kirjelda liinide koalestseerumist populatsiooni kasvamise/kahanemise korral! Kuidas see mõjutab genealoogia puu kuju? Koalestseerumised jagunevad selliselt, et esmalt toimub lühikese ajajooksul