- Klaad on taksonoomiline rühm, mis hõlmab endas viimase ühise eellase (liigi) ja kõiki selle eellase järeltulijaid. Klassifikatsiooniks kasutatakse erinevaid meetodeid traditsiooniline, kladistlik analüüs jt., mis erinevad tunnuste poolest, mida väärtustatakse. - Klaadide meetodi võttis kasutusele saksa bioloog Willi Hennig 1960-tel ja see on praegu peamine meetod organismidevaheliste sugulussidemete leidmiseks. - Klaadis on grupi liikmetel ühine evolutsiooniline ajalugu ja ühine eelane. Kõigi liikmetel peab olema ühine eriline päritav tunnus ehk sünapomorf, mida evolutsiooniliselt kaugematel eellastel ei esine. Mõisted 12: Evolutsioon populatsiooni genofondi muutumine ajas Genofond liigi v populatsiooni kõigi geenide hulk Sünapomorf e ühine eriline päritav tunnus Klaad küs 9 Rakuhingamine on kõikide rakuliste organismide rakus toimuvate metaboolsete protsesside
Hajuskordused: Transposeerumise tagajärjel on inimgenoomis umbes 45% kordusi, hiires 35%. Ka LINE järjestusi inimeses rohkem. Suurim erinevus SINE levikus. Inimesel üks (Alu), hiirel neli perekonda. Mis eristab meid genoomsel tasandil inimahvidest: Kas on toimunud divergents klaadidena või on toimunud üheaegne lahknemine (trihhotoomia). Enamik andmeid viitab Homo-Pan ühisele klaadile. Näit. 0,1 Mb autosomaalse fragmendi translokalisatsioon Y-kromosoomi H-P klaadis, Divergents H-P ja H-G vahel vastavalt 5-6 MYr ja 7-8 MYr tagasi. Liigiteke algas arvatavasti väikestest tsütogeneetilistest erinevustest (inversioonid) ja/või varajast embrüogeneesi reguleerivatest geenidest. 95% simpansi genoomist saab otseselt järjestada inimese omaga. Järjestuses erinevus 1,2% (35 mln.). Ülejäänu tekkinud indelite tulemusena (3%, 5 mln.) ja duplikatsioonid (2,7%). Inimesel esinevad arvukad ja liigispetsiifilised Alu alamperekonnad (Sb1 ja Sb2). Ortoloogsed
sama palju muutussamme. 8.10. Juurega puu puhul võime PAUPi kasutades anda käsud, mis võrdselt lühimate puude saamisel paneb kladogrammide genereerimisel programmi eelis- tama tunnuste paralleelset teket reversioonile (DELTRAN), või tagasipöördu- mist (reversiooni) paralleeltekkele (ALLTRAN). 8.11. Arvutiprogrammile võib "ette kirjutada" ka mitmesuguseid piiran- guid ja "sundkäike". Võime nõuda, et teatud liigid või liigirühmad peavad olema ühes harus (klaadis) koos; et teatud rühmad peavad olema kõrvutistes sõsarokstes (harudes). Sellised "sundused" (constraints) on tavaliselt õi- 24 gustatud ainult siis, kui need tuginevad mõnel eelnenud kladistilisel ana- lüüsil uuritava liigikogumi osahulga kohta. 8.12. Puu ehitamise mistahes algoritm (programm) püüab minimeerida puu pikkust, s.t. vältida homoplaasiat - paralleelsust ja tagasipöördumist. Iga
annaabi.ee 
