Alaniin (-CH3), glütsiin (-H) ja türosiin näiteks (Mõistet "peptiid" kasutatakse enamasti lühikeste, 210 aminohappest koosnevate ahelate kohta.) 9. oksüdatiivne fosforüülimine - ADP ensümaatiline fosforüülimine ATP-ks, mis toimub konjugeeritud molekulaarse hapniku taandamisega veeks taandatud koensüümidelt pärit elektronide arvel. NADH + H+ + 1/2O2 + xADP + xPi -> NAD+ + H2O + xATP FADH2 + 1/2O2 + xADP + xPi -> FAD + H2O + xATP 10. Tsitraaditsükkel on universaalne katabolismirada, kus toimub süsivesikute, lipiidide ja valkude degradatsioonil toodetud atsetüül-CoA oksüdeerimine CO2-ks Eukarüootides toimub tsükkel mitokondri maatriksis Tsükli iga ringiga siseneb 2 atsetüülrühma süsinikku atsetüül-CoA kujul ning lahkub kaks süsinikku CO2-na Iga tsükkel produtseerib taandatud elektronikandjad (3 NADH ja 1FADH2) Kaasneb O2 taandamine H2O-ks ja ATP süntees 11. beeta- oksüdatsioon : Rasvhapete oksüdatiivne degradatsioon atsetüül-CoA-ks, mis
Tsükli iga ringiga siseneb 2 atsüülrühma süsinikku CoA kujul ning lahkub 2 süsinikku CO2-na. Tsükli tinglikuks lähtepunktiks letakse atsetüül-CoA kondensatsiooni oksaalatsetaadiga, mille tulemusena moodustub tsitraat. Iga tsükkel produtseerib taandatud elektronikandjad, mille re-oksüdatsioon annab energia 1 ATP sünteesiks. Tsükli intermediaadid on biosünteesi lähteained. Eukarüootidel mitokondri maatriksis. TCA tsükli koht rakuenergeetikas. Universaalne katabolismirada, kus toimub süsivesikute, lipiidide ja valkude degradatsioon toodetud atsetüül-CoA lõplik oksüdeerimine CO2-ks. Produtseeritakse elektronikandjad NADH ja FADH2, mille reoksüdatsiooni arvel taandatakse hapnik veeks ning sünteesitakse ATP. Püruvaadi sisenemine TCA-sse. Seda katalüüsib püruvaadi dehüdrogenaasi kompleks, mis koosneb 3 ensüümist ja 5 + + koensüümist
kas püruvaadiks või tsitraaditsükli vaheproduktideks. Kuna tsüklis väljub pidevalt biosünteesi tarbeks vaheprodukte, siis on tarvis nende varu täiendada. Täiendatakse AcCoA aktseptori oksaalatsetaadi varu. Oksaalatsetaat moodustub kas püruvaai või PEPi karboksüülimisel. Paljudel mikroobidel on tsitraaditsükkel katkestatud ja seda kasutatakse just biosünteesi varustamiseks C-skelettidega. Enegia saadakse aga anorgaaniliste ainete oksüdatsioonist. Glükolüüs on heksooside katabolismirada, mida on peetud kõige ürgsemaks, kuna ta on väga laialdase levikuga: esineb peaaegu kõigis elusorganismideks: nii eu- kui ka prokarüootides. Rada nim ka EMP rajaks ehk Embdeni-Meyerhofi-Parnase rajaks selle raja kirjeldajate järgi. Glükolüüs on aluseks ka paljudele käärimistele. Glükolüüs kasutab 2ATP-d ja toodab 4 ATP-d. Glükolüüs toimub tsütoplasmas lahustuvate ensüümide vahendusel. Tema produktiks on püruvaat, mis võib aeroobsetes tingimustes
(NB! järgnev skeem on illustratiivne, seda ei pea peast teadma) 52 Süsivesikute lagundamisest saadav ATP-saagis sõltub metabolismiradadest, mida bakter katabolismiks kasutab. EMP rajas lagundatakse heksoos kaheks trioosfosfaadiks fruktoos-bisfosfaadi aldolaasi abil ning laktaadi lagundamisel saadakse saagiseks 2 ATP-d. See on kõige tavalisim glükoosi katabolismirada. Kuid näiteks Acetobacterium xylinum, Lactobacillum (heterofermentatiivsed liigid) ja Leuconostoc spp. lagundavad glükoosi pentoosfosfaadi rajas, kus glükoos muudetakse ksüloosiks, mille fosfoketolaas lagundab atsetüülfosfaadiks ja G3P-ks. G3P konverteeritakse EMP rajas püruvaadiks, mis edasi lagundatakse laktaadiks. Katabolismi saagiseks on 1 ATP- d, laktaat ja etanool. pentoos + 1Pi +1ADP -> laktaat + etanool + 1ATP + 2H2O (NB
annaabi.ee 
