Lüüsivalgu geenil puudub RBS järjestus Seepärast oimub L-geeni translatsioon järgmiselt: Ribosoom, mis transleerib kattevalgu geeni, jõuab oma terminaatorile ja toimub translatsiooni termineerumine. Peale terminatsiooni, võib see ribosoom tänu juhuslikule liikumisele piki RNA- d jõuda L-geeni algusesse ja alustada translatsiooni. Selline initsiatsioon toimub madala tõenäosusega, see tõenöosus on määratud kapsiidivalgu terminaatori (pos. 1727) ja lüüsivalgu initsiaatori (pos. 1678) vahel. Ribosoomi liikumine on juhuslik ja re-initseeritakse lähimal initsiaatoril. Selline mehhanism tagab ka L-valgu ekspressiooni hilises infektsioonis. Valmimisvalgu ekspressioon Valmimisvalku transleeritakse ainult kasvavalt mRNA ahelalt, kuna selle geeni RBS on vaba ainult senikaua kuni kasvav RNA molekul pole saavutanud alalist teise astme struktuuri, mille koosseisus RBS moodustab stabiilse dupleksi
11 VIROLOOGIA läbi plasmamembraani), kuna membraaniga interageeruvad ainult ISVP-d (või proteolüüsi läbi teinud virionid), kuid mitte terviklikud virionid ega "core"-partiklid. Interaktsioon peremeesraku membraanidega toimub välimise kapsiidivalgu µ1 kaudu (N- terminus on müristüleeritud, sisaldab amphipaatilisi heelikseid). Täpne tsütoplasmasse sisenemise mehhanism on teadmata. Oletatakse et ISVP interaktsioon membraaniga viib membraani lokaalse katkestuse tekkimiseni, või viiruse valgud moodustavad membraanis poori taolise struktuuri. Läbi selliste struktuuride (kumb mudel on õige pole veel teada) tungib rakku partikkel, mis koosneb "core" osakesest ja järelejäänud välimise kapsiidi valkudest (2-, -valk).
järgi. kõigi alternatiivsete koodonite kasutuse hulgast võetakse geomeetriline keskmine, mis ongi CAI. Terminatsioonifaktor II (RF II) tunneb ära UGA koodoni. Kui RF II-te on rakus vähe, siis toimub +1 raaminihe ja sünteesitakse RF II-te juurde. Enne seda on SD järjestus, et ribosoom oleks veits aeglasem. HIVis kapsiidi ja polümeraasi valgud kattuvad, aga kapsiidi on vaja umbes 100 korda rohkem. Transkribeeritakse üks mRNA. Enamus ribosoome transleerib kapsiidivalgu. Aga mõni ribosoom nihkub ühe nukleotiidi võrra tagasi (-1 raaminihe) ja terminatsioonikoodonit enam pole ja sünteesitakse liitvalk, mis hiljem üksteisest lahti lõigatakse. Raaminihke järel on pseudosõlme struktuur, kus ribosoom ei suuda läbi sõita, ja tänu sellele toimubki nihkumine. Pseudosõlm on see, kui juuksenõela paardumata osa paardub mingi edasise ahela osaga. Valkude väljumine ribosoomist.
annaabi.ee 
