väiksed molekulid (näit. metaboliidid). Nad paiknevad vastsünteesitud mRNA 5´- otsa läheduses. * RNA alternatiivse splaissingu negatiivne ja positiivne kontroll Negatiivne kontroll-repressorvalk seostub pre-mRNA-l kindlala järjestusele ning blokeerib splaissingu valkudenligipääsu. Positiivne kontroll- splaissingu valgud ei suuda eraldada kindlat intronit ilma aktivaatorvalguabita RNA toimetamine A-st l-ks-adeniini desaineerimine inosiiniks (aDAR ensüüm) C-st U-ks tsütosiiini deamineerimine uratsiiliks mRNA transport tuumast tsütoplasmasse on rakus rangelt reguleeritud. * Kontroll translatsiooni tasemel sh Shine-Dalgarno järjestus, translatsiooni alustamise kaks mehhanismi (nt rakkudes ja viirustes) Bakterites kontrollib mRNA translatsiooni konserveerunud nukleotiidne järjestus (Shine-Dalgarno järjestus), mis asub alustava AUG koodoni ees 1. Cap-dependent mechanism- Rakkudes algab translatsioon mRNA 5´-otsast AUG
metaboliidid). Nad paiknevad vastsünteesitud mRNA 5´-otsa läheduses. RNA alternatiivse splaissingu negatiivne ja positiivne kontroll (repressor- ja aktivaatorvalgud) Neg kontroll- Repressorvalk seostub pre-mRNA-l kindlale järjestusele ning blokeerib splaissingu valkude ligipääsu Pos kontroll- Splaissingu valgud ei suuda eraldada kindlat intronit ilma aktivaatorvalgu abita RNA toimetamine A-st I-ks- adeniini desaineerimine inosiiniks (ADAR ensüüm) C-st U-ks tsütosiini deamineerimine uratsiiliks (apolipoproteiin B äralõigatud osaga vorm) mRNA transport tuumast tsütoplasmasse on rakus rangelt reguleeritud. HIV puhul- osa viiruse mRNA jääb splaissimata ja ei tohiks tuumast lahkuda, splaissitud mRNA alusel süntesitakse Rev valk, mis toob ka splaissimata mRNA tuumast välja. mRNA-de ümberpaiknemine raku tsütoplasmas peale tuumast väljumist. Transport mööda tsütoskeletti ja seostumine ankuvalkudega
valgu järjestust (mRNA translatsiooni), premRNA splaissimist, RNA eluiga, RNA struktuuri, viiruste puhul ka replikatsiooni. DNA ja RNA muutuvad erinevaks. Nukleotiid asendatakse teiste nukleotiididega. Avastati taimede mitokondrites ja 66 trüpanosoomides (haigustekitajad). See on omane ka imetajatele (esineb palju). mRNa post-transriptsiooni modifikatsioonid – RNA toimetamine Levinum toimetamine: A → I (adeniin deamineeritakse inosiiniks) ja C→ U. I-s on 3 vesiniksidet. I hakkab C-ga paarduma, nukleotiidi tähendus on muutunud. See on oluline premRNA splaissimisel, RNA replikatsioonil, RNA degradatsiooni seisukohast. gRNA (guide RNA) esineb kohas, kus kindlas kohas splaissitakse. Selle alusel muudetakse sihtmärk RNA järjestust. RNA toimetamine ja viirusvastuse seos! RNA järjestust muutvad ensüümid seonduvad viiruse RNA-ga. Viirus võtab RNA järjest enam muutva ensüümi ja see tekitab viiruses mutatsiooni
annaabi.ee 
