Enamus hulkraksete organismide puhul aga on mRNAde eluiga mõõdetav tundidega. Mõnede geenide regulatsioon toimub hüppeliselt, näit tsütokiinide (immuunvastusega seotud valgud) puhul on see nii. Selline regulatsioon on võimalik tänu sellele, et nende geenide transkriptsiooni reguleeritakse kiire vastustena vastavate mRNAde eluea kaudu. Tsütoplasmaatiliste mRNAde lagundamine algab polü(A) sabast, kuni see on nii lühike, et PABPi ei saa enam siduda ega stabiliseerida 5'cap-i ja initsiatsioonifaktoritega moodustunud kompleksi. Eksponeeritud 5' cap struktuuri eemaldab decapping ensüüm ning kaitsmata mRNA lagundatakse 5'3' eksonukleaaside poolt. Polü(A) saba kõrvaldamine muudab mRNA 3' otsa tundlikuks ka eksosoomide 3'5 eksonukleaaside aktiivsuse suhtes. Deadenülatsioonikiirus on pöördvõrdeline sellelt mRNAlt translatsiooni initsiatsiooni sagedusega: mida kõrgem initsiatsiooni sagedus, seda aeglasem deadenüülimise kiirus. Mõnede mRNAde lagundamine ei sõltu deadenüülimisest
seega on transkriptsioon ja translatsioon ruumiliselt lahutatud. Eukarüootne mRNA läbib reeglina enne tsütoplasmasse jõudmist "protsessingu", mille käigus primaarsest transkriptist eraldatakse intronid ja lisatakse 5' otsa cap struktuur ning 3' otsa lisatakse poly(A) järjestus. Peale protsessingut transporditakse küps mRNA läbi tuumapooride tsütoplasmasse. Nii "cap" kui polü(A) on lisaks mRNA stabiilsusele ja transpordile vajalikud ka mRNA seondumiseks eukarüootsete initsiatsioonifaktoritega ja soodustavad väga tugevalt translatsiooni initsiatsiooni. Initsiaatorkoodon AUG asub sageli 5' otsa läheduses (40-100 nt. cap'ist). Paljudel eukarüootsetel mRNA'del on 30 initsiaator-koodon siiski cap-st väga kaugel, see vahe võib olla kuni tuhandeid nukleotiide. Initsiaator-AUG on raamistatud spetsiifilise kontekst-järjestusega A/GNNAUGG, mida nimetatakse avastaja järgi Kozak'i konsensuseks
cap ―AUG ―UGA ― juuksenõel ― STOP. UGA kodeerib sec’i teket (selenotsüsteiin, sealt tekivad juuksenõelad). Enne on vaja pausi. Lisaks on veel 3’UTR-s spetsiaalne järjestus – SECIS – määrab ka sec’i lülitumise. SECIS toimib ainult üks kord. dihüdrofolaadi reduktaas. cis-elemendita seonduvad ka rasvhapped. 34 cap ja polü (A) on vajalikud: 1) mRNA stabiilsus 2) mRNA transport 3) mRNA seondumiseks initsiatsioonifaktoritega ja soodustavad väga tugevalt translatsiooni initsiatsiooni. PAP – poly A binding protein. Initsiatsioonifaktor. Poly A-sait on cis-element ja PAP on trans-faktor. PAP seostub eIFG4-ga ja toob mRNA 3’ otsa 5’ otsa lähedale. eIF4 A ja B viivad läbi ribosoomi liikumist; A hüdrolüüsib ATP-d ja destabiliseerib mRNA-d. Suur kompleks hakkab koos liikuma mööda mRNA-d 5’ → 3’ suunas kui tunnet ära AUG – mRNA skaneerimine – tähtsus 40S ja Met-tRNA.
annaabi.ee 
