Koodon- antikoodon paardumine. tRNA saab valgusünteesil seondada 3 kohta A-, P ja E-sait asuvad suures subühikus. Esimesena seondutakse A-saiti, siis P-saiti, siis E-saiti. 66. Võrrelge translatsiooni initsiatsiooni bakterites ja eukarüootses rakus. Bakterites kontrollitakse valgusünteesi taset sellega. Osalevad ribosoomi 30S subühik, mRNA, spetsiaalne initsiaator-tRNA, kolm initsiatsioonifaktorit (IF1, IF2, IF3) ja GTP kolekul. Enne translatsiooni on ribosoomid jaotunud kaheks sübühikuks. Olulist rolli mängib mRNA 5' ots, mis seondub ribosoomi väikses SUs 16S rRNAga. See ala, kus mRNA ja 16S rRNA seonduvad nim RBSiks ribosime binding site. Kõige täpsemini sobituvad täiesti komplementaarsed järjestused. Mida sarnasem järjestus, seda kiiremini seondub ja täpsem on translatsiooni initsiatsioon. Teine oluline regulatsiooni mehhanism on
subühikud on eraldi ja ribosoomid on läbinud valgusünteesi ribosoomi tsükli (joon. 8.9). Valgusünteesi initsiatsioonil osalevad lisaks ribosoomidele ka valgulised initsiatsioonifaktorid, initsiaator-tRNA ja GTP. Initsiatsioon toimub prokarüootidel ja eukarüootidel võrdlemisi suurte erinevustega, seepärast käsitleme siin ainult prokarüootset initsiatsiooni ja eukarüootide valgusünteesi omapära käsitleme eraldi peatükis. Bakteritel on kaks konserveerunud valgusünteesi initsiatsioonifaktorit, mõnedel bakteritel on kolm erinevat initsiatsioonifaktorit. Neist IF-2 on suur valk (molekulmass 110 kD), IF-3 ja IF-1 on väikesed valgud (9 ja 25 kD vastavalt). IF-2 ja IF-3 esinevad kõigil bakteritel. IF-2 seob GTP juuresolekul initsiaator-tRNA'd, mis bakterites on fMet-tRNAfMet. Sellise kolmik-kompleksina seondub IF-2 ribosoomi väiksema subühikuga ja moodustab viimasega stabiilse kompleksi. IF-2 on GTP'd siduv valk ja tal on teistele GTP'ga seonduvatele valkudele omane valgudomään nn
seostuda enne mRNA seostumist. Kui translatsioonifaktorid on seondunud, siis peab fMet-tRNA ka olemas olema ja seostub väiksema subühikuga. Toimub koodon- antikoodon interaktsioon. Moodustub kaheahelaline RNA, mis saab 50S subühikuga seonduda. fMet-tRNA läheb otse P-saiti, kõik teised lähevad läbi A-saidi. Kui kompleks on korrektselt moodustunud, siis kõik faktorid vabanevad ja tekib 70S initsiatsioonikompleks, kus initsiaatorkoodon paigas. Bakteritel on kaks konserveerunud initsiatsioonifaktorit (IF), mõnel on kolm IF-i. IF-2 on suur valk, IF-1 ja IF-3 väikesed. IF-2 ja IF-3 esinevad kõigil bakteritel IF-1 kiirendab IF-de seostumist 50S-ga. Aitab tRNA-l P-saiti ja blokeerib A-saidi. IF-2: (GTP-fMet-tRNA) - seob GTP juuresolekul initsiaator-tRNA-d (bakterites on fMet-tRNA fmet). Juhendab initsiaator-tRNA P-saiti. - seondub ribosoomi väikse subühikuga ja moodustub stabiilne kompleks. - GTP-d siduv valk ja on teistele GTP-d siduvatele valkudele omane valgudomään – GTP domään
annaabi.ee 
