TBP is a subunit of the eukaryotic transcription factor TFIID. TFIID is the first protein to bind to DNA during the formation of the pre-initiation transcription complex of RNA polymerase II. TBP is also a necessary component of RNA polymerase I and RNA polymerase III, and is, it is thought, the only common subunit required by all three of the RNA polymerases. · HAT histoonide atsetüültranseferaas. Histone acetyltransferases (HATs) are enzymes that acetylate conserved lysine amino acids on histone proteins by transferring an acetyl group from acetyl CoA to form -N-acetyllysine. DNA is wrapped around histones, and by transferring an acetyl group to the histones, genes can be turned on and off. Histone acetylation increases gene expression. In general, histone acetylation is linked to
tekkinud RNA-d töödeld Aktivaatorvalk – vajalik transkriptsiooni alustamiseks. Nad võivad tuhandeid nukleotiide promootorpiirkonnast eemal asuda. (kõik vajalik – RNA polümeraas, üldised transkriptsioonifaktorid, mediaatorid, kromatiini- ja histone ümberkujundav kompleks – saaks promootorile seostuda) promoo tor 43. Prokarüootide ja kromatiini eukarüootide mRNA üldise struktuuri võrdlus. ümberkujundav
polümeraasi funktsiooni lokaalselt. Vaigistamise puhul katavad valgud ühtlaselt teatava DNA regiooni ja takistavad sinna teiste valkude seondumist. Selle tulemusena ei ole DNA kättesaadav ei DNA-d modifitseerivatele ensüümidele ega ka ligipääsetav RNA polümeraasile. Transkriptsiooni vaigistamine on üks põhilisi transkriptsiooni kontrollmehhanisme eukarüootides, bakterites on see vähem levinud. Mõned näited: H-NS (histone-like nucleoid-structuring protein) kondenseerib sarnaselt histoonidele DNA-d (samas on ta histoonidest struktuuri poolest erinev ning laengult neutraalne). H-NS vaigistab näiteks D-glükosiidide kasutamisega seotud bgl geene, seondudes 100-bp pikkusele AT-rikkale alale, mis asub nende geenide promootorist ülalpool. H-NS seondub eelistatult korduvat AT-motiivi sisaldavale paindega DNA-le ja oligomeriseerub seal. H-NS mõjutab ka DNA topoloogiat, suurendades DNA negatiivset
NS-ga CbpA - - - Paindunu 33 kDa Homodimeer või d DNA heterodimeer CbpM-ga CbpB - - - Paindunu 33 kDa monomeer d DNA H-NS (inglise keeles histone-like nucleoid-structuring) on mittespetsiifiline transkriptsiooni repressor. H-NS-i homoloogid (sarnase funktsiooniga, järjestus pole sarnane) ja ortoloogid (järjestu-selt sarnased, sama funktsioon) on väga levinud bakterite hulgas. Tõenäoliselt ongi konserveerunud funktsioon siduda DNA-d valguliste sildade abil, mitte aminohappeline järjestus. H-NS seondub superspiraliseeritud DNA-le, tal pole väga tugevalt konserveerunud DNA järjestust, millega valk seonduks