Subühik II: faagi R-valk Subühik III: raku translatsiooni (elongatsiooni) faktor EF-Tu Subühik IV: raku translatsiooni (elongatsiooni) faktor EF-Ts Seega kuulub faagi replikaasi kolm raku translatsiooni osalevat valku, mis moodustavad koos viiruse valguga aktiivse replikaasikompleksi. Negatiivsete ahelate sünteesiks on vaja kõiki nelja subühikut. Lisaks sellele on negatiivsete ahelate sünteesil abifaktoriks bakteri geeni hfq product (nn.host factor), mis hülbustab tugevalt struktureeritud mRNA-dele ligipääsemist. IFQ on E.coli polyA järjestusi seonduv valk ja tema loomulik funktsioon on transkriptsioonifaktor sigma mRNA translatsiooni soodustamine. IFQ on heksameer, erinevalt kolmest ülejäänud raku faktorist ei seondu RdRp-ga vaid hoopis faagi RNA (positiivne ahel) 3’ otsaga (-CAAoh) mis on selle valgu puudumisel dupleksis lähedal asuvate G-jääkidega
kirjeldati esmalt sait-spetsiifilisel rekombinatsioonil. Fis on oluline ka eksponentsiaalses faasis tugevalt ekspresseeruvate geenide (rRNA ja tRNA geenid) transkriptsioonil ja DNA replikatsioonil. Eksponentsiaalses faasis on Fis valku 60000 molekuli raku kohta, kuid statsionaarses faasis jääb ta detekteerimatuks (alla 100 molekuli). Seega on Fis kasvavates rakkudes üheks põhiliseks nukleoidiga assotsieeruvaks valguks. Hfq (host factor for phage Q), tuntud ka faktori i nimetuse all, seondub nii DNA-ga kui ka RNA-ga. Seondumine on mittespetsiifiline, kuid toimub eelistatult paindunud DNA-le. Eksponentsiaalses faasis on Hfq-d ligikaudu 55000 molekuli raku kohta. Statsionaarses faasis valgu hulk langeb järk-järgult, jõudes tasemeni, mis vastab 1/3-le maksimaalsest. Lisaks DNA-le on Hfq assotsieerunud ka ribosoomidega ning
aeglustumisel ja statsionaarse faasi rakkudes. Statsionaarse faasi faktor S, geeni rpoS produkt on oluline nende geenide avaldumisel, mida bakterid vajavad tingimustes, kus nende kasv on pärsitud. Rakkude üleminekul eksponentsiaalsest kasvufaasist statsionaarsesse tõuseb rpoS mRNA kogus raku kohta 20 korda, valgu hulk aga 100 korda. rpoS mRNA moodustab sekundaarstruktuuri, mis takistab mRNA transleerimist. Selleks, et mRNA muutuks transleeritavaks, peab temaga seonduma RNA shaperon Hfq. Muutused statsionaarse faasi rakkudes: 1) Membraanis muutub rasvhapete sisaldus, suureneb rakkude adhesioon ning rakud agregeeruvad. Rakud on ka väiksemad ja ümaramad. Suureneb rakkude liikuvus. Viburite süntees on siiski ajutine, kuna nõuab liialt energiat. 2) Toimuvad muutused kromosoomi topoloogias, väheneb DNA superspiralisatsioon. Rakus muutub DNA- ga seonduvate valkude tase (H-NS, IHF, Dps). Need valgud reguleerivad geenide ekspressiooni taset
ki3#.Kjp#
3de4C#Y,65iw
),yO#x#4#x>k;
by# JF1o7V
Hpk#? ?^#2#5KKI#h`
#?hJ#0##:
Q#Qj-:%{^*:jU'v #
#FG{##X$:,#9#N#b2#0cB#ol#e#|
/ /#Z[iz#4#S#Z
3Y,>C? ###
annaabi.ee 
