(D.radiodurans). Teatavates situatsioonides ka 10 koopiat (M.jannaschi), Genoomide suurus jääb 1-5Mb vahele. Väiksem genoom M.genitalium 517 geeni (genoomi suurus 580 kb), suurim M.xanthus 9,2 Mb. Genoomi suurus sõltub geeniduplikatsioonidest (sage arhebakteritel) ja korduselementide olemasolust ning arvust, ~85% genoomist valke kodeeriv (parasitaarsel M.leprae vaid 47,5%), GC hulk varieerub 67%-25%, Eukarüootidest erinev koodonite kasutamissagedus. Geeniproduktide funktsionaalsed grupid: energiametabolismiga seotud, transportvalgud, valgusünteesiga seotud, rakuliste protsessidega seotud, regulatoorse funktsiooniga, rakukest, DNA metabolismiga seotud jne. 5. Prokarüootsete mudelorganismide genoomiprojektid (E.coli, bakteriofaagid, multiresistentsuplasmiidid). Bakteriofaagide genoom enamasti kaheahelaline DNA (ka üheahelaline DNA või RNA). Suurus 1.6 kb 150 kb, umbes 200 geeni, lugemisraamid tihti kattuvad. E.coli (soolekepike) genoom: Sekveneeritud 1997 a. Genoom 4 639 221 bp
2. Anaeroobne hingamine membraanis toimuv elektronide ülekandmise protsess. Kasutab hapnikule alternatiivseid elektronaktseptoreid nagu nitraat, nitrit, fumaraat, dimetüülsulfoksiid (DMSO) ja trimetüülamiin N-oksiid (TMAO) 3. Fermenteerimine e. käärimine toimub anaeroobsetes tingimustes terminaalsete elektronaktseptorite puudumisel. Energiat genereeritakse substraadi tasemel fosforüleerimisel. Energiametabolismiga seotud geene kontrollitakse nelja erineva regulaatorite rühma poolt · ArcA/ArcB represseerib peamiselt aeroobse hingamisega ja tsitraaditsükli tööga seotud funktsioone. · FnR toimib peamiselt anaeroobsete radade aktivaatorina, kuid represseerib ka mõningaid geene, mis on aktiivsed bakterite aeroobsel kasvul. · NarL/NarP/NarX/NarQ on aktiveeritavad anaeroobsetes tingimustes nitraadi ja nitriti poolt.
7-bp pikkust otsekordusjärjestust CTGTCAT, mis on teineteisest eraldatud 4-bp pikkuse järjestusega. Pho boks kattub osaliselt promootori 35 heksameeri alaga, millel puudub arvestatav sarnasus 35 elemendi konsensusjärjestusega. Arvatakse, et PhoB kontakteerub otseselt RNA polümeraasiga. Lisaks Pi kontsentratsioonist sõltuvale kontrollile koordineerivad Pho reguloni geenide transkriptsiooni veel 2 signaalse transduktsiooni rada, mis seovad nende geenide regulatsiooni C- ja energiametabolismiga: 1. Sensorkinaasi CreC poolt kontrollitud signaali ülekandesüsteem 2. Regulatsioon atsetüülfosfaadi kaudu. Atstüülfosfaat tekib vaheühendina fosfotransatsetülaasi Pta ja atsetaadi kinaasi AckA reaktsioonis: Pta AckA Atsetüül CoA + Pi atsetüülfosfaat atsetaat + ATP CoA ADP Nende reaktsioonide tulemusena inkorporeeritakse P i ATP-sse, mis on metabolismis esmaseks fosforüülrühma doonoriks
annaabi.ee 
