fosfaatrühma vaheline 2'5'-fosfodiesterside. Teise struktuurse muutuse tulemusena, teise transesterifikatsiooni reaktsiooni käigus, (2) ligeeritakse kaks eksonit omavahel 3'5'fosfodiestersideme moodustumise tulemusena, nii 7 et intron vabaneb harulise lariaat-struktuurina. Pikkade pre-mRNAde puhul osalevad eksoni äratundmisel SR valgud. SR valgud interakteeruvud eksoni järjestusega, mida nim eksoonseteks splaisingu võimendajateks (ESE). Pärast ESEga seondumist vahendavad nad U1snRNPde kooperatiivset sidumist korrektsele 5' splaissaidile ja U2snRNPde õige branch point'I äratundmist. Nende ja teiste splaisingfaktorite kompleks, mis moodustub eksoni peale nim cross-exon recognition complex. 36. Missugused U snRNAd osalevad pre-mRNA splaisingu regulatsioonis? Splaisingus osalevad viis väikest U-rikast tuuma RNAd (snRNA), mida tähistatakse U1, U2, U4, U5 ja U6. Nad
moodustub branchpoint A 2'hüdroksüülrühma ja introni 5' otsa fosfaatrühma vaheline 2'5'- fosfodiesterside. Teise struktuurse muutuse tulemusena, teise transesterifikatsiooni reaktsiooni käigus, (2) ligeeritakse kaks eksonit omavahel 3'5'fosfodiestersideme moodustumise tulemusena, nii et intron vabaneb harulise lariaat-struktuurina. Pikkade pre-mRNAde puhul osalevad eksoni äratundmisel SR valgud. SR valgud interakteeruvud eksoni järjestusega, mida nim eksoonseteks splaisingu võimendajateks (ESE). Pärast ESEga seondumist vahendavad nad U1snRNPde kooperatiivset sidumist korrektsele 5' splaissaidile ja U2snRNPde õige branch point'I äratundmist. Nende ja teiste splaisingfaktorite kompleks, mis moodustub eksoni peale nim cross-exon recognition complex. RNA editing on pre-mRNAde järjestuste muutmise alternatiivseks mooduseks. Editing on protsess, mille tagajärjel muudetakse pre-mRNA järjestust, st küpse mRNA järjestus erineb vastavast
Splaisingu mehanism splaisosoom katalüüsib kahe transeserifikatsiooni toimumist, mille tulemusena eksonid splaisitakse ja intron lõigatakse lariaatstruktuurina välja. Eksoni äratundmine toimub tänu sellele, et pre-mRNAdel on intronite otstes mõõdukalt korduvad lühikesed järjestused ja 3' splaissaidist ülavoolu asub pürimidiin-rikas järjestus, SR valgud osalevad eksoni äratundmises pikkade pre-mRNAde puhul, SR valgud interakteeruvad eksoni järjestustega, mida nim. eksoonseteks splaisingu võimendajateks. Splaisingu ja transkriptsiooni sidusus lühikeste transkriptsiooniühikute puhul toimub RNA splaising reeglina pärast 3' lõikamist ja polüadenülatsiooni, pikkade transkriptsiooniühikute puhul, mis koosnevad mitmest eksonist, toimub eksonite splaising sünteesitavas RNAs enne, kui geeni transkriptsioon on lõppenud, s.o. transkriptsiooni ajal; transkriptsioon ja splaising toimuvad väikeses hulgas rakutuumas asuvates struktuurides. pre-mRNA 3' lõikamine ja
3500bp. Pikimad intronid on kuni 500kb pikad. Kuna 5' ja 3' splaissaitide ja branchpointi järjestused on suhteliselt kõdunud, siis pikkades intronites esineb neid järjestusi mitmete koopiatena. Järelikult on vaja veel mingit lisainformatsiooni, et eksoni piire ära tunda. Eksoni rekognitsiooni kompleksne mehanism hõlmab SR valkude aktiivsust. SR valgud interakteeruvad eksoni järjestustega, mida nim. eksoonseteks splaisingu võimendajateks (exonic splicing enhancer). SR valkudel on üks või enam RRMi ning mitu valk-valk interkatsiooni pinda, mis on suhteliselt arginiini ja seriniini rikkad. Kui SR valgud on exonic splicing enhancer'ga seotud, siis nad vahendavad U1snRNPde kooperatiivset sidumist korrektsele 5' splaissaidile ja U2 snRNPde õige branchpointi äratundmist. SR valkude, snRNPde ja teiste splaisingfaktorite (U2AF) kompleks,