Molekulaardiagnostiliste meetodite võrdlus: Southern blot: -eelised: Parim tuvastamaks suuri genoomseid muutusi -puudused: Töömahukas, vajab palju lähtematerjali Sekveneerimine: -eelised: Tuvastab kõik muutused -puudused: Kallis Heterodupleks analüüs: -eelised: Lihtne ja odav -puudused: Puudulik tundlikus,Väikesed fragmendid dHPLC: -eelised: Kiire ja kvantitatiivne -puudused: Kallis, ei selgu asukoht SSCP: -eelised: Lihtne ja odav -puudused: Väikesed fragmendid DGGE: -eelised: Kõrge tundlikus -puudused: Kallid praimerid 17.TaqMan ja Molecular Beacon töötamisprintsiip Homogeensed hübridisatsioonitestid kasutades reaalaja PCR-d ja fluorestsentsil põhinevat detektsiooni: -Tuntumad TaqMan ja Molecular Beacon proovid.Erinevad quencherid (TAMRA ja DABCYL) -Põhinevad energia ülekandel, kus fluorestsents detekteeritakse tänu muutusele füüsikalises distantsis fluorokroomi ja vaigistaja (quencher) vahel pärast proovide hübridisatsiooni
Mulliga liiguvad tavaliselt aeglasemalt ja on geelis ootamatute kohtade peal. RFLP ensümaatilisel restriktsioonil põhinev polümorfismide analüüs. Esinevad polümorfismid, mis tekitavad või kaotavad restriktsioonisaite. Regioon amplifitseeritakse ja pannakse restriktaas juurde. Kui restriktsioonisait on kadunud, siis tekib üks suur bänd 2 väikese asemel. Reaalselt on sel vähe kasutusvõimalusi. DGGE Spetspraimerid, mille otsas on GC-clamp'id, mille sulamistäpid on arvutatavad. Amplifitseeritakse kontroll- ja uuritav proov. Produkt hakkab denatureeruma (uurea vmt toimel) erinevates piirkondades sõltuvalt mutatsiooni olemasolust. Keemiline RNAas vahendatud: üks praimeripaar on biotiiniga märgistatud. Kui tekib heterodupleks ja seal on mullike (mittepaardumine)....(?) Kui on fluorestseeruv praimer, saame lisapiigi. Valgu lühenemise test: Stoppkoodonite tuvastamiseks
unique sensorial traits. chain reaction (PCR). The availability of 185 186 Chapter 9 new, powerful, and reliable techniques has is not taken into consideration. This weak- enabled the detailed study of this complex ness can be addressed by the application of ecosystem. Table 9.1 lists techniques used techniques such as PCR-DGGE, which for the identification of technological micro- instead of relying on culturing of the bacteria, biota in fermented sausages throughout the incorporates the direct extraction of the DNA world. The phenotypic approach (i.e., the from the food sample. Furthermore, another identification based on assimilation–fermen- technique that has not yet been applied in tation–growth challenges) has been the first fermented sausages is fluorescence in situ
annaabi.ee 
