Dekodeeriv tsenter tRNA kaheetapiline selektsioon : Near-cognate tRNA dissotsiatsioon kiireneb - initial selection (IS) ajal - proofreading (F) ajal • Non-cognate tRNA IS-ist edasi ei jõuagi • GTP hüdrolüüsi kiirus tRNA-st ei sõltu • EF-Tu kui “internal clock” • Near-cognate tRNA korral suurem GTP kulu NB! Vaadake ”Translatsiooni täpsus” slaidi nr. 34 Koodon-antikoodon dupleksi struktuur ja interaktsioon dekodeeriva tsentriga DNA/RNA kaksikheeliksi suur ja väike vagu A-minor interaktsioon Dekodeeriv tsenter : dekodeerivas tsentris on kaks lapatsina liikuvat RNA nukleotiidi A1492 ja A1493 käib vaid koodonites 1 ja 2 (väikese vao poolt) kolmandas ei ole, seal saab toimuda too wobble paardumine. A minor paardumine aitab energeetiliselt paardumisele kaasa, ilma selleta tuleb lisakulutused
peale elongatsioonitsükli käsitlemist seoses translatsiooni elongatsiooni hübriidsaitide mudeliga. Lisaks tRNA sidumiskohtadele on ribosoomis veel aktiivtsentrid. Ribosoomi dekodeeriv tsenter asub ribosoomi väiksemal subühikul. Dekodeerivas tsentris toimub koodon-antikoodon äratundmine. Selles protsessis osaleb ribosoom aktiivselt, ribosoomis toimuv koodon-antikoodon interaktsioon on stabiilsem ja täpsem kui vabas lahuses tRNA antikoodoni ja mRNA koodoni paardumine. Dekodeeriva tsentri moodustumisel osalevad nii 16S rRNA kui ribosoomi väiksema subühiku valgud. Dekodeeriva tsenri läheduses paikneb ribosoomi väiksemal subühikul mRNA sidumispiirkond, mis toimib valgusünteesi initsiatsioonil. See piirkond koosneb eranditult rRNA'st ja moodustub 16S rRNA 3' otsas, mis paardub mRNA ribosoomi seondumispiirkonnaga (nn. anti-Shine-Dalgarno järjestus). Ribosoomi suuremal subühikul asuvad peptiidsideme moodustumist katalüüsiv tsenter e.
tRNA lahkub ribosoomilt. Ribosoom sisaldab 3 saiti tRNA sidumiseks. Kogu aeg samaaegselt 2 tRNA-d ribosoomiga seotud. Väiksemal subühikul asub mRNA kanal. Koodon-antikoodon paardumine toimub väiksemas subühikus. tRNA aktiivtsentrid: Ribosoomi dekodeeriv tsenter – asub väiksemal subühikul. Toimub koodon- antikoodon äratundmine. Moodustavad 16S rRNA ja väiksema subühiku valgud. mRNA sidumispiirkond – dekodeeriva tsentri läheduses, väiksemal subühikul. Toimib valgusünteesi initsiatsioonil. Koosneb rRNA-st ja moodustub 16S rRNA 3’ otsas, mis paardub mRNA seondumispiirkonnaga. peptidüültransferaasne tsenter – peptiidsideme moodustumist katalüüsiv tsenter – asub ribosoomi suuremal subühikul. Piirkond, kuhu seonduvad aa-tRNA ja peptidüül- tRNA 3’ otsad koos vastava AH ja kasvava peptiidahelaga. valgusünteesi faktoreid siduv tsenter – 1) AH siduv tsenter koosneb 23 S rRNA-st
annaabi.ee 
