positsioonis (GUG ja UUG on sagedased 10%). tRNAde väiksema arvu jaoks kasutatakse mitokondrites kolmandas positsioonis tihti inosiini, mis on guaniini sarnane. Lisaks on antikoodoni kõrval metülatsioon ja pseudouridiin. Wobble paardumine. Inosiin esineb tRNA-s ja on vajalik wobble aluspaaride õigeks translatsiooniks. Inosine (I) at position 34 (wobble position) of tRNA is formed by the hydrolytic deamination of a genomically encoded adenosine (A) (reaktsiooni katalüüsib tRNA A:34 deaminaas). Adeniin muudetakse kas adenosiin-/inosiinmonofosfaadiks, mis järgnevalt muudetakseinosooniks. Alternatiivsed geneetilised koodid (mitokondrite erinevad koodid, alternatiivsed koodid bakteritel, pärmidel) Mitokondris: AGA - Ter* (Arg) AGG - Ter* (Arg) AUA - Met (Ile) UGA - Trp (Ter*) Muutused koodis ehk koodoni tähenduse muutused, saavad toimuda vaid siis kui koodon esineb vaid vähestes geenides. Alternatiivsed koodid on peamiselt mitokondrites ja
(E. coli's GadB), mis lagundab glutamaadi -aminovõihappeks ehk GABA-ks (inglise keeles -amonibutyric acid), arginiini dekarbüksolaas ja lüsiini dekarboksülaas. GadB partner GadC abil transporditakse tsütoplasmast GABA välja. GABA transportimisega välja transporditakse glutamiinhape rakku. Vastupidiselt happelisele keskkonnale, aktiveeritakse aluselises keskkonnas aminohapete deaminaasid näiteks trüptofaani deaminaas TnaA või metabolismirajad, mis toodavad orgaanilisi happeid. hüdrogenaas: glutamaadi dekarboksülaas: 37 trüptofaani deaminaas ehk trüptonaas: Transkriptsiooni reguleerimine. E. coli hakkab väga happelises keskkonnas (maohape) ekspresseerima sigma-faktoreid, mis lülitavad sisse geenid, mis on vajalikud happelise keskkonnaga toime tulemiseks. Lisaks
gRNA-l on oma ankurboks – UGGA järjestus - selline järjestus, mille koha pealt toimetamine lõpeb (toimetamise lõpusignaal). Ankru ees asub toimetamise piirkond. Märklaud RNA lõigatakse katki, sinna vahele pannakse gRNA järjestuses määratud nukleotiidid. Ankurboks – selline järjestus, mille koha peal tometamine lõpeb ehk lõppsigaal. Selle ankru ees toimub toimetamine. Ahel tehakse katki, sinna vahele pannakse nukleotiid gRNA abil. Nii saab toimetatud RNA valmis. Adenosiini deaminaas (ADAR) – Toimub U-de lisamine ja C-de muutmine. Osaleb RNA vaigistamisel. Kui eukarüooti jõuab RNA viirus, siis ADAR paljudel juhtudel muudab viiruse RNA-s A → I-ks. Rakus esinevad sellised ensüümid, mis lagundavad RNA-d, kui sisaldab I-d. Viiruste RNA-d ei ole õiged ja sellepärast antakse signaal nende RNA-de lagundamiseks. ADAR konkureerib teiste RNA ensüümidega. 2) teatud nukleotiidi eemaldamine 3) nukleotiidi asendus