Kuna 32 ja 70 on RNA polümeraasi suhtes ühesuguse afiinsusega, toimub regulatsioon faktorite aktiivsuse kaudu. 70 on RNA polümeraasi subühikutest temperatuurile kõige tundlikum. Temperatuuritõusu tagajärjel on 70 inaktiivne, agregeerunud vormis. Nii saab RNA polümeraasi apoensüüm siduda teist faktorit. DnaJ, DnaK ja GrpE moodustavad 32-ga stabiilse kompleksi, eksponeerides teda proteaasidele (membraanseoseline ATP-sõltuv proteaas FtsH e. HflB ning tsütoplasmaatilised ClpAP, SslVU ja Lon). HS tagajärjel on shaperonid hõivatud denatureerunud valkude kõrvaldamisega rakust. Selle tagajärjel vabaneb 32 shaperonidest ning seondub RNA polümeraasi apoensüümiga, olles seal paremini kaitstud ka proteaaside eest. 32 toimub suureneb drastiliselt HS geenide transkriptsioonitase, mis võimaldab kiiresti sünteesida HS valke, k.a. shaperone. Shaperonide toimel 70 reaktiveeritakse ning ta on jällegi võimeline seonduma konkureerivalt RNA polümeraasi apoensüümiga.
Võrreldes DNA-ga on RNA denaturatsioonile ja termodegradatsioonile tundlikum, kuna: 1) ta on üksikahelaline; 2) riboosi 2´ OH-rühm on kõrge reaktiivsusega fosfodiestersidemele. Kuumashoki valgud Kuumashoki valgud HSP-d (heat shock proteins) ekspresseeruvad basaalsel tasemel ka normaalsel temperatuuril. Nagu juba eespool mainitud, on enamus HSP-sid molekulaarsed shaperonid ja ATP-sõltuvad proteaasid (Lon, ClpAP), mis osalevad valkude voltimisel, assambleerimisel, transpordil, reparatsioonil ja degradatsioonil. Järgnevalt käsitlen põhjalikumalt molekulaarseid shaperone. Molekulaarsed shaperonid jaotatakse kahte perekonda Hsp70 ja Hsp60, seda nende sarnasuse alusel eukarüootsetele HSP-dele. Hsp70 perekond - siia kuulub DnaK, mis toimib koos GrpE ja DnaJ-ga ning on eeskätt stabiliseeriva funktsiooniga. 60
aktiivseks. Osa teadlasi arvab, et toksiin-antitoksiin süsteemidega pole võimalik bakteri metabolismi reaktiveerida. 11.1.1. MazEF-süsteem E. coli toksiin-antitoksiin süsteem. MazF on toksiin ja MazE on antitoksiin. MazF on endoribonukleaas, mis tunneb ära mRNA-l ACA järjestuse ning lõikab mRNA katki esimese A ja C vahelt. MazE pool eluiga on umbes 30 minutit ning MazE on degradeeritav ATP-st sõltuva proteaasiga ClpAP. MazF on stabiilne, selle pool eluiga on umbes 4 tundi. Kui rakud on näljastressis ning aminohapete puudusel suureneb alarmooni ppGpp kontsentratsioon rakus, siis ppGpp pärsib mazEF operonilt transkriptsiooni. Kuna MazE on lühema elueaga, siis proteaasid lagundavad antitoksiini ning MazF vabaneb inhibitsioonist. MazEF-ga vahendatud autolüüs on populatsiooni fenomen. Antibiootikumid, mis takistavad transkriptsiooni ja/või translatsiooni (rifampitsiin, klooramfenikool)