Kui omavahel paarduvad nukleotiidid regioonidest 1 ja 2 ning 3 ja 4, moodustuvad sekundaarstruktuurid, mis termineerivad transkriptsiooni, kui aga omavahel paarduvad nukleotiidid regioonidest 2 ja 3, on terminatsiooni põhjustavate juuksenõelastruktuuride moodustumine takistatud ning transkriptsioon jätkub. 50. Seleta lühidalt antiterminatsiooni mehanismi põhimõtet. Kasuta oma selgituses jooniseid. Antiterminatsioonil on kirjeldatud 2 mehhanismi: (1) RNA polümeraasi modifitseerimine nii, et transkriptsioon ei termineeru terminaatorjärjestusel (faag lambda terminaatorid, rrn operonid). (2) Terminaatori moodustumine on takistatud valgulise faktori abil, mis seondub mRNA-ga. Teisel juhul seondub transkribeeritava geeni liiderjärjestusele antiterminaator-valk, moodustub alternatiivne sekundaarstruktuur, mis kattub terminaatorjärjestusega (või lõhub terminaatori)
translatsioon sellel kohal peatub ning rho-faktor saab seonduda RNA-ga, mille tulemusena transkriptsioon termineerub. Trüptofaani ülehulgas tõuseb tnaAB transkriptsioonitase rakus 100 korda, kuna rho-sõltuvat transkriptsiooni terminatsiooni ei toimu. Transkriptsiooni antiterminatsioon regulaatorvalkude abil Transkriptsiooni antiterminatsiooni spetsiifiliste valkude abil on kirjeldatud eeskätt suurte operonide puhul, kus geenide avaldumine toimub etapiviisiliselt. Antiterminatsioonil on kirjeldatud 2 mehhanismi: 1) RNA polümeraasi modifitseerimine nii, et transkriptsioon ei termineeru terminaatorjärjestusel (faag lambda terminaatorid, rrn operonid). 2) Terminaatori moodustumine on takistatud valgulise faktori abil, mis seondub mRNA-ga. Antiterminatsioon valgulise faktori abil, mis seondub mRNA-ga a) Biosünteesi regulatsioon Bacillus subtilise trp operon on negatiivselt reguleeritud TRAP (Trp Attenuator Protein) poolt. Trp
Klass II CS valgud on need, mis ekspresseeruvad olulisel määral ka 37C juures ning temperatuurilanguse korral indutseeritakse neid vähem kui 10 korda. 1) Klassi I kuuluvad valgud CspA, CspB, CspG, CsdA, RbfA, NusA ja PNPaas. CspA, CspB ja CspG on RNA/DNA shaperonid, CsdA on ribosoomiga assotsieerunud valk, millel on RNA sekundaarstruktuure lahtikeerav aktiivsus. RbfA on ribosoomiga seonduv valk. NusA osaleb transkriptsiooni terminatsioonil ja antiterminatsioonil. PNPaas on ribonukleaas. 2) Klassi II kuuluvad valgud RecA, translatsiooni initsiatsioonifaktor IF-2, H-NS, DNA güraas GyrA. CS-spetsiifilisi faktoreid pole leitud. CS vastusega kaasnevad regulatoorsed muutused toimuvad transkriptsiooni aktivatsiooni järgselt. CS valkude induktsioonitase sõltub temperatuurilanguse ulatusest. Hiljuti leiti veel valk TF (trigger factor), mille madalal tasemel süntees indutseeritakse vastusena külma- shokile pärast 2 3-tunnist lag perioodi