i 4 6—7 1 ut 6 — 14* 8 kleepimisreeglid on täpselt samad nagu olid ka MDNK leidmisel ! v 10 — 14* 4 r kleepides kõikvõimalikud 2sed grupid : iga 4ne grupp kleepimistabelis vastab ühele 4-ruudulisele kontuurile : A index laiend. 0de pk. 2-sed interv. vahe 4-sed interv. vahe x 3 x4 0 1 — 3* 2 x 1 x2 00 01 11 10 1 1 1—5 4
Nimi Asukoht Eelised Puudused Hinnaklass Asiris Nuna Nurme tee Jõgi lähedal, valikus Võimalus olla 1ne tuba 20/öö Hostel 15, Audru palju erineva omaette majas, 2ne tuba 33/öö vald, suurusega tube. kui on ka teisi 3ne tuba 40/öö Papsaare, Lisavoodi võimalus. Pärnu Sauna olemasolu. 4ne tuba 50/öö Suur maa-ala ümber Lisavoodi 5/öö hosteli Saun 10 Kaevu Kaevu 42, Võimalus rentida 3ne tuba 70/öö Puhkemaja Pärnu tervet maja, saun, 4ne tuba 70/öö sviit, vaid 1,5 km
AGA! Ei saa alati eeldada selle kehtimist väiksemate organismide puhul! 7. Selgita populatsiooni diversiteediparameetrit Θ (teeta) ja seda defineerivat valemit! Mis on lihtsaim viis teeta väärtuse hindamiseks DNA järjestuste alusel? Nukleotiidide mitmekesisus populatsioonis θ (teeta) on oodatav keskmine erinevate nukleotiidide arv kahe juhusliku järjestuse vahel. Väärtus antakse kas kogu järjestuse või 1 saidi kohta. Valem : θ = 4Neµ Kui 1 põlvkonna kohta tekib 1µ mutatsiooni (µ on mutatsioonikiirus) ja koalestsentsipuul on keskmine oodatav aeg 2 liini ühinemiseni 2Ne generatsiooni, siis keskmine oodatav mutatsioonide arv 2 järjestuse vahel on 2*2Neµ (sest 2 järjestust = 2 haru puul) Iga koalestsentsi-intervalli (puu harupikkus 2N ühikutes) τ (tau) jooksul on oodatav keskmine mutatsioonide arv 1 liinis 2Neµτ = τθ/2
Natalja Iga geen on tehtud saitide järjestusest ja igal korral kui mutatsioon toimub, ta mõjutab saitile, mis eelnevalt oli mõjutamata. 7. Selgita populatsiooni diversiteediparameetrit Θ (teeta) ja seda defineerivat valemit! Mis on lihtsaim viis teeta väärtuse hindamiseks DNA järjestuste alusel? Teeta on kahe järjestuse vaheline keskmine erinevus. Kuna keskmiselt elas kahe geeni ühine eelasgeen 2Ne põlvkonda tagasi, siis järelikult lahutab kahte geeni 2 korda 2Ne põlvkonda ehk 4Ne põlvkonda. Kui teame mutatsioonide tekkesagedust ühes põlvkonnas, siis saame arvutada välja teeta ehk kahe järjestuse vahelist keskmist erinevust θ=4Neμ. 8. Selgita lühidalt, mis on “skyline” mudel populatsiooni efektiivse suuruse hindamiseks. Ne= uk(k-1)/2. Ne pop.suurus ajal; u aja pikkus; k liinide arv. Lävendist lühemad intervallid liidetakse naabriga. 9. Mis on populatsiooni efektiivne suurus Ne? Nimeta mõned Ne alaliigid.
annaabi.ee 
