is sequencing of the 16S-rRNA gene. This place. technique has been applied either in combi- The microorganisms that are most fre- nation with other techniques, such as SDS- quently encountered are Lactobacillus curva- PAGE of whole cell proteins, RAPD-PCR, tus, Lb. plantarum, Lb. sakei, Staphylococcus or PFGE, or directly to the isolated microor- carnosus, St. saprophyticus, and St. xylosus ganism. Although this approach provides (Table 9.1). These microorganisms seem to accurate identification at strain level, an be autochthonous in this ecosystem and have equally important part of the microbiota, the capacity to prevail during fermentation. namely the viable but not culturable fraction, The competitiveness of Lb. sakei has been Table 9.1. Microbial diversity in spontaneously fermented sausages throughout the world
piimanäärmetes, sooltes ja suguelundites. Nahal on neid kõige enam higi- ja rasunäärmete piirkonnas: peanahk, näonahk, ninaküljed, varbavahed. Seetõttu on nad ka tavalised haavainfektsioonide põhjustajad. Sageli on haiglapersonal koloniseeritud stafülokokkidega. Stafülokokke on sporaadiliselt isoleeritud ka mullast, mere- ja mageveest, taimedelt ja õhust. Arvatakse, et nad on sinna sattunud loomadelt ja inimeselt. Vabalt looduses ilmselt neid baktereid eriti pole. Arvatakse, et S. xylosus, mis suudab kasutada ka anorg. N, võiks ilmselt elada ka vabalt looduses. Patogeensed stafülokokid. S. epidermidis on valkjate või kollakate kolooniatega koagulaasnegatiivne stafülokokk. Ta on valdav peanahal, aga teda on ka teiste piirkondade nahal. Eriti palju sigineb teda pärast murdeiga, kui nahk muutub rasuseks. Põhjustab näiteks endoproteeside infektsioone (puusa- ja põlveproteesid, südameklapid, veenisisesed kateetrid.
annaabi.ee 
