RNaas III - dsRNA spetsiifiline endoribonukleaas, mis hürdolüüsib rohkem kui 10 aluspaarise dsRNA fosfodiestersidemed. RNAi puhul toimub pikkade dsRNA'de lagundamine väiksemateks fragmentideks (21-25 aluspaari), mida viivad läbi RNaas III homoloogid, näiteks Drosophilas valk nimega Dicer. siRNA - vaigistamist indutseeriv RNA on RNaas III sarnaste ensüümide hüdrolüüsi produkt, 21-25 nt pikk, mis on kas "sense" või "antisense" järjestuse orientatsiooniga. RISC - RNA indutseeritud vaigistuskompleks (RNA induced silencing complex). See on RNAi põhiline efektorkompleks, mis lagundab siRNA'ga homoloogse mRNA. Seega siRNA kuulub koos mitmete valkudega RISC kompleksi. Helikaasid - dsRNA'd või dsDNA'd lahtiharutavad ensüümid. Neurosposa puhul on leitud et DNA helikaas osaleb RNAi toimumisel. Teistes organismides on leitud, et RNAi jaoks on vajalikud RNA helikaasid.
49 - Hok ja Sok geenid – Hok – (host killing) peremehe tapja ja Sok – (supressor of killing) tapmise takistaja. Hok produktiks on valk. Sok’ilt sünteesitakse antisense RNA. Kui Sok’i pole, on võimalik Hok-ilt valgusüntees. - bakteri periplasmas on palju RNAaase ja DNAaase, mis kaitsevad viiruste sissetungi eest. RISC – RNA indutseeritud vaigistuskompleks (RNA induced silencing complex). See on RNAi põhiline efektorkompleks, mis lagundab siRNA-ga homoloogse mRNA. Seega siRNA kuulub koos mitmete valkudega RISC kompleksi. Helikaasid – dsRNA-d või dsDNA-d lahtiharutavad ensüümid. Neurosposa puhul on leitud, et DNA helikaas osaleb RNAi toimumisel. Teistes organismides on leitud, et RNAi jaoks on vajalikud RNA helikaasid. Transkriptsiooni regulatsioon prokarüootidel