Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse
Sulge

"tuimala" - 2 õppematerjali

Bioinformaatika ülesanded II - Fülogeneetilised puud
2
doc

Bioinformaatika ülesanded II - Fülogeneetilised puud.

c. Moodustada nende järjestuste jaoks fülogeneetilised puud kasutades erinevatel arvutusmeetoditel (kaugusmeetodid, MP, ML) baseeruvaid fülogeneetiliste puude koostamise programme PHYLIP paketis (http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html, tutvuda programmide dokumentatsiooniga, kasutusjuhend http://koti.mbnet.fi/tuimala/oppaat/phylip2.pdf) ­ salvestatud MSA fail peab olema PHYLIP formaadis: 1. MP metoodi kasutamisel arvutada fülogeneetilised puud kasutades järgmisi programme: a. DNAPARS b. DNAPENNY c. DNAMOVE d. Joonistada välja juurtega (DRAWGRAM) ja juurteta puu (DRAWTREE). Joonistamisel tuleb valida Bitmapi

Informaatika → Bioinformaatika
42 allalaadimist
Bioinformaatika arvestus ül
21
doc

Bioinformaatika arvestus ül

c. Moodustada nende järjestuste jaoks fülogeneetilised puud kasutades erinevatel arvutusmeetoditel (kaugusmeetodid, MP, ML) baseeruvaid fülogeneetiliste puude koostamise programme PHYLIP paketis (http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html, tutvuda programmide dokumentatsiooniga, kasutusjuhend http://koti.mbnet.fi/tuimala/oppaat/phylip2.pdf) ­ salvestatud MSA fail peab olema PHYLIP formaadis: 1. MP metoodi kasutamisel arvutada fülogeneetilised puud kasutades järgmisi programme: Vastus: a. DNAPARS DNA parsimony algorithm, version 3.66 One most parsimonious tree found: +spt_SPA025 +--3 +--2 +stm_STM024 | | | +sfl_SF4435 | 1-ece_Z0213 | +eco_b0201 requires a total of 82.000

Informaatika → Bioinformaatika
38 allalaadimist


Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun