TBP on TFIID subühik, mis vastutab TATA boxi järjestuse ära tundmise eest ja TFIID-l sellele seostumise eest, unikaalne DNA-painutamine pärast TBP seostumist aitab ka teistel TF-del DNA-le seostuda. Nii moodustubki transkriptsiooni initsiatsiooni kompleks. Prokarüootidel toimub tranksriptsiooni initsiatsioon teisiti, ilma TBPta: Bakteriaalse polütsistroonse mRNA ribosoomaalsed sidumissaidid asuvad mRNA valkekodeeriva ala ehk tsistroni ees. Translatsiooni initsiatsioon võib alata ükskõik milliselt neist paljudest ribosoomi sidumissaitidest, mille tulemusena üks mRNA võib kodeerida erinevaid valke. Enamike eukarüootsete mRNAde puhul määrab 5'-cap struktuur ära ribosoomi sidumiskoha ja translatsioon algab lähimalt AUG koodonilt. Selle tulemusena translatsioon saab alata vaid ühelt saidilt. Paljudel juhtudel eukarüootsed valku-kodeerivad primaarsed transkriptid protsessitakse üht
Transkriptsiooni käigus teine TFIIH alaühik fosforüülib paljudest erinevatest positsioonidest RNAPolII CTDi. In vitro katsetest on selgunud, et TBP jääb TATAboxiga seotuks matriitsahela transkriptsiooni lõpuni, samas kui ülejaanud GTFid dissotseeruvad kompleksist. 15. Võrdle transkriptsiooni initsitatsiooni protsesse prokarüootidel ja eukarüootidel. Bakteriaalse polütsistroonse mRNA ribosoomaalsed sidumissaidid asuvad mRNA valkekodeeriva ala ehk tsistroni ees. Translatsiooni initsiatsioon võib alata ükskõik milliselt neist paljudest ribosoomi sidumissaitidest, mille tulemusena üks mRNA võib kodeerida erinevaid valke. Enamike eukarüootsete mRNAde puhul määrab 5'-cap struktuur ära ribosoomi sidumiskoha ja translatsioon algab lähimalt AUG koodonilt. Selle tulemusena translatsioon saab alata vaid ühelt saidilt. Paljudel juhtudel
pole alanud. Takistab 50S subühiku seondumist. IF-3 peab olema enne seotud 30S-ga, kui toimivad järgmise translatsioonifaktorid. IF-1 kiirendab IF-3 ja IF-2 seostumist ja pärast nende lahkumist. IF-3 peab olema enne, siis IF-2 koos GTP ja fMet tRNA-ga seotuakse mRNA-ga (väikesesse subühikusse). Prokarüootidel on mRNA transkriptsioon seotud translatsiooniga (!) Prokarüootidel kattuvad initsiaatorkoodon ja terminaatorkoodon UAAUGA → UAA/AUG/UGA Esimese mRNA tsistroni transleerimiseks on vaja subühikute dissotsiatsiooni, hiljem enam mitte. mRNA seostub 30S-ga (30 S pinnal on koodon-antikoodon äratundmine). RNA ühel poolel on seotud 30S subühik, teisel pool suurem 50S subühik. EPA – tRNA seostumiskohad, ei vaja abivahendeid. Prokarüootide mRNA: Eukarüootidel on: üks mRNA kodeerib ühe valgu ja toimub cap-struktuuri seondumine (identifisteerib mRNA). Prokarüootides: ühelt mRNA-lt kodeeritakse mitut valku ja
annaabi.ee 
