Taime rakkude vahel on poorid, miskaudu toimub reguleeritud ainete transport. Vaigistamine levib süsteemselt niinerakkude (floeem) kaudu. Viirustel on valgud, mis suruvad alla RNA vaigistamise. RNA vaigistamise häirimisega saab viirus häirida taime viiruskaitse mehhanismi. Häirijad-valgud võivad olla aktiivsed igas faasis. Transgeenide vaigistamine Taime viidud transgeenid on sageli siRNA poolt vaigistatud Vaigistamise lülitab sisse: Väga kõrge ekspressiooni tase dsRNA, mis tekib transgeenilt Hälvik RNA-d, mida transgeen kodeerib Transgeene vaigistatakse post-transkriptsionaalselt ja ka transkriptsiooni ajal. 1980-tel lõid teadlased meetodi, et viia geene taime genoomi, kasutades taime patogeeni Agrobacterium tumefaciens (bakter). Sisestatud geene kutsutakse transgeenideks. Kalkooni süntaas on ensüüm, mis on oluline antotsüaanide biosünteetilise raja alguses. Fenomen, kus mõlemad geenid (transgeen ja oma geen) on vaigistatud, nimetatakse `koos- allasurumiseks.
DNA kui sellelt transkribeeritava mRNA kui sellelt transleeritava valgu detekteerimise abil. Põhimõtteliselt on võimalikud ka teised analüüsiviisid, näiteks ensümaatilise reaktsiooni produkti detekteerimine keemilise analüüsi abil (juhul, kui võõrgeenilt ekspresseeritakse ensüümi) või siis fenotüübiline iseloomustamine (herbitsiiditaluvuse järgi). Reaalselt kasutatakse geneetiliselt modifitseeritud taimede eristamiseks looduslikest kahte meetodit: ELISA transgeenilt ekspresseeritavate spetsiifiliste valkude olemasolu produktis detekteeritakse nende kui antigeenide seostumise järgi vastavate spetsiifiliste antikehadega; PCR põhineb võõr-DNA spetsiifilise järjestuse detekteerimisel. Need meetodid ei ole vastandlikud, vaid täiendavad teineteist. 16. Taimede geneetilisel muundamisel enamkasutatavad regulatoorsed nukleotiidjärjestused. · NptII kodeerib neomütsiin fosfotransferaasi