Eesti tootjad ja töötlejad omavad pikaajalisi traditsiooni kalatöötlemises. Põhitegevusalad Eesti kalatöötlemises on kala külmutamine, fileerimine, kalakonservide ja –preservide ning valmistoitude tootmine Külmutatud kala omab selgelt suurimat osakaalu, ehk üle poole kalatoodete tootmisest. Seda saab kindlasti seletada, et kilu ja räime põhiliselt külmutatakse, mis on ka suurima osakaaluga eesti kalandussektorist püütavatest kaladest. Külmhoonetesse ning tootmisbaasidesse on alatasa üleinvesteeritud ning tootlemisvõimsus on palju suurem, kui sisse tulev toodang. Samas on tootmishooned amortiseerinud ning suure energiakuluga, mis on paljud firmad viinud pankrotilähedasse seisu. Töötlemishoonetesse investeeritakse vähe, kuna see on liialt kallis. Väga suur osa tehakse ära eurorahadega. Kuigi kvoodid aina vähenevad on Eksport aasta-aastalt suurenenud. 2011. aastal jäi 22% Eesti kalatoodangust Eestisse tarvimiseks, 78% eksporditi
1,9 Kulinaarsed kalatooted õlis, marinaadis, kastmes Kalakonservid Allikas: Eesti Statistikaamet Külmhoonete ja fileerimistsehhide struktuuri iseloomustab väikeste üksuste suur arv. Kohati on tootmisbaasidesse üleinvesteeritud ning tootmisvõimsus on suurem, kui olemasoleva tooraine töötlemiseks vaja on. Samas on tootmishooned amortiseerunud ning suurte energiakuludega. See olukord iseloomustab peaasjalikult mageveekalaliikide töötlemisüksusi. Pelaagilisi kalaliike nagu kilu ja räim töödeldakse enamjaolt tootjaorganisatsioonide poolt rajatud kompaktsetes külmhoonetes, mis on varustatud kaasaegseimate tehnoloogiliste lahendustega nii töötlemises aspektist kui ka toodete pakendamises.