katabolismi, glutamiini sünteesi, piilide, jne. sünteesi kodeerivate geenide avaldumist. Erinevate bakterite genoomide analüüsi põhjal võib väita, et 54 on levinud paljudes bakterites, ka graam- positiivsetes (näit. B. subtilis), puudub aga kõrge G + C sisaldusega bakterites Mycobacterium tuberculosis, Rickettsia prowazekii, Mycobacterium genitalium ja M. pneumoniae. Erinevalt 70-tüüpi promootoritest on 54-tüüpi promootorite järjestus märksa enam konserveerunud: järjestus TGGCAC-N5-TTGCa/t paikneb regioonis -26 kuni -11, kusjuures GG ja GC vahelist kaugust (10 bp) ei tohi muuta. Erinevalt 70-st on 54 võimeline seonduma promootoriga ka ilma RNA polümeraasi koostisesse kuulumata. 54 võimaldab RNA polümeraasil seonduda spetsiifiliselt promootoriga, kuid sellest ei piisa avatud kompleksi tekkeks. Avatud kompleksi moodustumiseks on vajalik RNA polümeraasi interaktsioon aktivaatorvalguga ja ATP hüdrolüüs. Ilma aktivaatorita on promootor inaktiivne
-35 element ei pruugi sugugi sarnaneda TTGACA järjestusele, ometigi mutatsioonid selles piirkonnas muudavad sigmaS-ga transkriptsiooni regulatsiooni isegi siis, kui järjestus ei sarnane TTGACA-ga. -10 element on suhteliselt sarnane sigmaD -10 elemendiga. -10 elemendist ülesvoolu on konserveerunud lisanukleotiidid, mida sigmaD -10 elemendil pole. SigmaS-i promootorite vaheala pikkus varieerub rohkem kui sigmaD vaheala pikkus. SigmaN (-24 element, vaheala, -12 element) TGGCAC N6 TGC E. coli sigmaN-i konsensus DNA-l erineb sigmaD konsensusest tugevasti ning põhimõtteliselt seisneb -12 positsioonis konserveerunud GC-s ja -24 positsioonis konserveernud GG-st. SigmaH (-35 element, vaheala, -10 element) CCTTGAA N 14(1) CCCATTTA SigmaF (-35 element, vaheala, -10 element) TAAAGTTT N 11 GCCGATAA RNAP on väga suur valk, u 450 kDa raske, ning sellest johtuvalt katab RNAP DNA promootoralas kuni 110 nukleotiidi (-90 ... +20 nukleotiidi geeni
annaabi.ee 
