algpopulatsioone ja hindab igale uuringusse kaasatud proovile tõenäosuse millega ta pärineb igast ühest neist hüpoteetilisestest algpopulatsioonidest. 7. Kirjelda Patterson’i D (või ABBA – BABA) testi. Kasutame välisgrupi genoomi, et määrata eelasseisund igas genoomi positsioonis. Seejärel loeme kokku mitmes positsioonis jagab testgenoom sama nukleotiidi populatsiooniga A või B. Saame teada kummaga on testpopulatsioon sarnasem. 8. Mis on haplotüüpidel põhinevate meetodite nagu näiteks finestructure peamine eelis genotüübi andmetele tuginevate meetodite ees. Haplotüübianalüüs – erinevuste vaatlemine iseloomuliku mustrina koos edasipäranduvate aheldunud kromosoomi lõikude levikus populatsioonis. Meetod, mis kasutab populatsioonide klasterdamisel haplotüüpide infot ja on seeläbi tundlikum. Suudab ilusasti eristada hiljuti lahknenud populatsioonid. 9
erinevate k väärtuste. Selle struktuuri hierarhilisuses sisaldub ka fülogeneetiline info, kuid kahjuks mitte ainult. Mida me näeme, on siiski lihtsalt erinevuste struktuur erinevatel resolutsiooni astmetel. 7. Kirjelda Patterson’i D (või ABBA – BABA) testi. (Ahto) Kasutame välisgrupi genoomi, et määrata eelasseisund igas genoomi positsioonis. Seejärel loeme kokku mitmes positsioonis jagab testgenoom sama nukleotiidi populatsiooniga A või B. Saame teada kummaga on testpopulatsioon sarnasem. Näide: H1, H2 ja H3 märgivad 3 inimpopulatsiooni ning testi kasutatakse, et hinnata, kas andmed on kooskõlas nullhüpoteesiga (milleks on siis nt puu: ((H1, H2), H3), šimpans ning et pole toimunud geenivoolu H3 ja H1 vahel või H3 ja H2 vahel). Järgnevalt arvutatakse D statistiku väärtus: D = (nABBA-nBABA)/ (nABBA+nBABA), kus nABBA on saitide arv, kus H1 omab samu allele šimpansiga ja H2 ning H3 omavad erinevaid allele (ABBA saidid)
annaabi.ee 
