Intergeensed supressorid: Palju funktsioone mRNA translatsioonil. Iga supressorgeen töötab vaid üht tüüpi nonsense, missense või frameshift mutatsioonil. Suppressorgeenid sageli kodeerivad tRNAd, mille antikoodon paardub stopkoodoniga ja paneb sinna aminohappe. Kolm tRNA nonsense supressorit; üks igale stop kodonile (UAG, UAA, UGA). tRNA suppressorgeeenid on koos metsiku tRNA-GA. tRNA suppressorid võistlevad vabanemis (release) faktoriga, mis on vajalik õigeks polüpeptiidahele terminatsiooniks. Spontantaansed ja indutseeritud mutatsioonid: Spontaansed mutatsioonid võivad toimuda igas rakutsükli faasis. Transposoonide liikumine põhjustab sp.mut. Mutatsioonide määr = ~10-4 - 10-6 mutatsiooni /geen/põlvkond. Määr on erinevates genoomi osades erinev, palju sp.mut.repareeritakse. Transponeerumine tekivas spontaansed mutatsioonid tänu sellele, et transposoon võib minna mõne geeni keskele. On erinevad, tingitud näiteks retroviirustest, esinevad nii pro- kui
asuva stop koodoni poolt. - 1 raaminihe tekib A-järjestustel kõrge sagedusega. Seetõttu sünteesitakse gamma ja tau subühikuid bakterirakus suhtes 1:4. Raaminihke toimumist soodustab mRNA-s UGA koodonile järgnev juuksenõelastruktuur. Polüpeptiidide sünteesi terminatsioonil osaleva faktori RF-2 (release factor-2) süntees saab toimuda ainult tänu raaminihkele. Kui RF-2 kogus on rakus madal, on seda valku kodeeriva mRNA algusosas sisalduv stop koodon UGA translatsiooni terminatsiooniks ebapiisav. Sel juhul ribosoom küll peatub, kuid nihkub 3 U kohal +1 lugemisraami transleerimisele. Ainult nii sünteesitakse funktsionaalne valk. Programmeeritud lugemisraami muutmist on kirjeldatud ka mobiilsete DNA elementide transpositsioonil osalevate valkude sünteesil. Sünteesitakse näiteks transposaasi ja tema lühemat varianti, mis toimib transposaasi repressorina. Mõningatel juhtudel võib ribosoom jätta mRNA-st transleerimata mitukümmend nukleotiidi. Sellist
valkude pakkimine ning degradeerimine. 68 Keskkonnast vastuvõetud signaalile võib bakter reageerida erinevalt, muutes ainult ühe geeni avaldumist või reguleerides mitme või isegi sadade geenide avaldumist korraga. Selleks, et toimuks geenide avaldumine, on esmalt vaja geene transkribeerida RNA-ks. Transkriptsioon jaguneb initsiatsiooniks, elongatsiooniks ning terminatsiooniks. Transkriptsioon algab RNA-polümeraasi (RNAP) seondumisega spetsiifilise DNA järjestusega, mida nimetatakse promootoriks, ning suletud kompleksi moodustumisega. Suletud kompleksiks nimetatakse RNAP-DNA kompleksi, kui polümeraas on seondunud DNA-ga, kuid pole veel transkriptsiooni initsieerinud. Selleks, et alustada RNA sünteesi on vajalik DNA ahelate lahtisulamine ehk avatud kompleksi moodustumine. Kui RNAP paneb paika RNA 10 esimest