sellele kromosoomi osale, millel on väga kõrge samasuse aste. Sond on iseenesest lühike DNA jupp (100 500 ap), mis on denatureeritud üheahelaliseks ning seejärel markeeritud flurestseeruvate markeritega. Fluorestents mikroskoopia abil saab üles leida kromosoomi piirkonna, kuhu sond on seostunud. Cod-FISH: (chromosome orientation and direction FISH) määrab kromosoomi 3' 5' orientatsiooni ja inversioone (ümberpööratud jupp). Suuna annab C-rikka ahela telomeerses piirkonnas hübridiseerinud sond. Q-FISH: telomeeride pikkuse tuvastamine. Kasutatakse telomeerspetsiifilisi PNA'sid (peptiidsidemetega nukleiinhapped), võimaldab võrrelda individuaalsete telomeeride pikkusi. Subtelomeersed deletsioonid nõrgamõistuslikkuse sage põhjus. Q-FISH'i edasiarendus on Flow- FISH: kasutatakse interfaasi rakke, hübridiseeritakse lahuses (3D keskkond) paljude rakkude üheaegne analüüs. Signaal tuvastatakse FACSiga.
Lihtsad kordusjärjestused ‘Satelliit’-DNA, ‘minisatelliit’- ja ‘mikrosatelliit’- kordused: jaotuvus genoomis; ülesanded (kui on) genoomis; evolutsiooniline konserveeritus; mutageensus ja vead replikatsioonil/rekombinatsioonil; olulisimad kasutamisvõimalused genoomi uuringutes ja geneetika-uuringute rakendundustes. • Satelliit-DNA – suurtest tandeemselt korduva mittekodeeriva DNA blokkidest koosnev järjestus. Paikneb enamasti kromosoomi telomeerses või tsentromeerses piirkonnas. Moodustab heterokromatiini struktuuri põhi koostisosa. Stimuleerib ja säilitab epigeneetilisi heterokromatiniseerimise signaali nt H3K9 deatsetülerimine ja metüleerimine ning vastutab funktsionaalse tsentromeeri eest. Ei ole evolutsiooniliselt konserveerunud. • • Minisatelliit kordused – koosnevad keskmise suuruseda tandeemselt korduva mittekodeeriva DNA blokkidest. Esinevad telomeeride läheduses. Sageda
annaabi.ee 
