kannab poliitilist vastutust protsessi tõhusa ja eesmärgipärase kulgemise eest. Peaminister esindab Eestit ka ÜK kohtumistel ning valitsusjuhtide tasandil kokkutuleva EL Nõukogu kohtumistel. Ministeeriumid: vastutavad EL-i algatuste ja eelnõude kohta Eesti seisukohtade väljatöötamise eest oma vastutusalas ja nende kaitsmise eest EL-i otsustusprotsessis. Ministeeriumide ametnikud osalevad nõukogu töögruppides ja komiteedes eelnõude menetlemisel, valmistavad ministrile taustamaterjale nõukogu kohtumisteks. Riigikantselei EL asjade sekretariaat: nõustab valitsust EL-ga seotud küsimustes ja osaleb valitsuse EL asjade seisukohtade kujundamises, toetab peaministrit tema EL-i suunalises töös. Välisministeeriumi EL osakond: aitab kujundada Eesti seisukohti üld- ja institutsionaalsetes küsimustes. Eesti alaline esindus EL juures: esindab valitsust EL-i institutsioonides (nõukogu, Coreper, nõukogu töögrupid, erikomiteed, EK komiteed)
Peaminister esindab Eestit ka ÜK kohtumistel ning valitsusjuhtide tasandil kokkutuleva EL Nõukogu kohtumistel. · Ministeeriumid: vastutavad EL-i algatuste ja eelnõude kohta Eesti seisukohtade väljatöötamise eest oma vastutusalas ja nende kaitsmise eest EL-i otsustusprotsessis. Ministeeriumide ametnikud osalevad nõukogu töögruppides ja komiteedes eelnõude menetlemisel, valmistavad ministrile taustamaterjale nõukogu kohtumisteks. · Konsultatsioonikogu (KOK): valitsuse korraldusega moodustatud ministeeriumidevaheline komisjon. · Koordinatsioonisüsteemi keskne organ, peamine ülesanne arutada ja lahendada kõiki Eesti EL-is osalemise küsimusi ja võimalikke probleeme. · Läbi KOK-i tagatakse valitsusele esitatavate seisukohtade kooskõlastatus ministeeriumide vahel.