Septumi moodustumise asukohta koguneb rakujagunemise initsiaatorvalk FtsZ. 34. Bacillus'e geenide ajaline regulatsioon sporulatsiooni erinevatel etappidel. Emarakus ja prespooris avalduvad erinevad sigma faktorid, mis kontrollivad emaraku ja prespoori diferentseerumist. B. subtilis'e põhiline sigma faktor on A. Sporulatsiooni-spetsiifiliste geenide avaldumist kontrollivad sigma faktorid on E, F, G ja K. Sporulatsiooni erinevatel etappidel ekspresseeruvad erinevad sigma faktorid. Sporulatsioonis osalevate geenide avaldumine on kontrollitud nii ajaliselt kui ka ruumiliselt: 1) Faktorid E ja K on seotud emaraku varajaste ja hiliste geenide avaldumisega 2) Faktorid F ja G kontrollivad varajasi ja hiliseid prespooris avalduvaid geene. Sporulatsiooni varajaste geenide avaldumine Prespooris avalduv sigma faktor F on kodeeritud Spo0A-P poolt aktiveeritava SpoIIA operoni viimase geeni spoIIAC poolt. Sellele geenile eelnevate geenide spoIIAA ja spoIIAB produktid kontrollivad F aktiivsust.
Diferentseerumisel moodustub sporulatsiooniseptum. Septumi moodustumise asukohta koguneb rakujagunemise initsiaatorvalk FtsZ. Sporulatsiooni erinevatel staadiumidel avalduvad sigma faktorid B. subtilis'e põhiline sigma faktor (E. coli 70 analoog) on A. Sporulatsiooni-spetsiifiliste geenide avaldumist kontrollivad sigma faktorid on E, F, G ja K. Sporulatsiooni erinevatel etappidel ekspresseeruvad erinevad sigma faktorid. Sporulatsioonis osalevate geenide avaldumine on kontrollitud nii ajaliselt kui ka ruumiliselt: 1) Faktorid E ja K on seotud emaraku varajaste ja hiliste geenide avaldumisega 2) Faktorid F ja G kontrollivad varajasi ja hiliseid prespooris avalduvaid geene. Üldse on B. subtilis'el kirjeldatud 9 erinevat sigma faktorit. Faktorid A (põhiline sigma faktor), B (üldine stressi sigma faktor), C (?) ja D (rakkude liikumisorganid)