geenipuu ja liigipuu vahel? Liigipuu kujutab liikide evolutsioonilist arengukäiku. Sisemised sõlmed kujutavad liigitekke sündmusi. Geenipuu kujutab geenide evolutsioonilist arengukäiku. Sisemised sõlmed kujutavad geeniduplikatsioone ja/või liigitekke sündmusi. Geenipuu ei ole identne liigipuuga, ühele liigipuule võib vastata palju geenipuid. Põhjused miks geenipuu ei ole liigipuuga identne: Liinide mittetäielik sorteerumine Geenide duplikatsioon ja kadumaminek Horisontaalne geeniülekanne Hübridisatsioon Rekombinatsioon 19. Iseloomustage homoloogsete geenide tüüpe (orto-, para- ja ksenoloogsed geenid). Milliseid neist eelistatakse fülogeneesipuu konstrueerimisel ja miks? Ortoloogsed geenid on homoloogsed geenid, mis on tekkinud liigitekke teel ühisest eellasgeenist. Ehk geenid kahest eri liigist, mis
Mudelitest järeldus, et see on bilanss väljasuremise ja immigratsiooni vahel. Liikide mitmekesisuste erinevust saartel seletatakse suuruse ja kauguse abil. Saarte puhul näeb selgelt rajaja efekti. Esmalt on immigrante palju, sest ökonisid on vabad, kiiresti tekib konkurents. Üks kahest sarnasest liigist sureb välja või mõlemad mitmekesistuvad ajaliselt või ruumiliselt. 15. Kuidas muutub populatsioonide eristumisel ema või isapoolsete geeniliinide sorteerumine, missuguse topoloogiaga puud tekivad põlvkondade möödudes? Eristunud ja algpopulatsioon moodustavad alguses polüfüleetilise puu (puudub ühine eellane), põlvkondade möödudes polüfüülia väheneb ja populatsioonid jagunevad monofüleetiliseks (eellane) ning teine veel mitte, moodustades parafüleetilise (eellane, järglane puudu) faasi. Mida suuremad on populatsioonid, seda rohkem läheb aega monofüleetilise populatsiooni väljakujunemiseks. 16